Protein–RNA interactions for Protein: Q99LV7

Pigx, Phosphatidylinositol-glycan biosynthesis class X protein, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PigxQ99LV7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.9■■■■□ 3.82
PigxQ99LV7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PigxQ99LV7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PigxQ99LV7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PigxQ99LV7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PigxQ99LV7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
PigxQ99LV7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PigxQ99LV7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
PigxQ99LV7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
PigxQ99LV7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PigxQ99LV7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PigxQ99LV7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PigxQ99LV7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
PigxQ99LV7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.57■■■□□ 2.81
PigxQ99LV7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
PigxQ99LV7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PigxQ99LV7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PigxQ99LV7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PigxQ99LV7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PigxQ99LV7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PigxQ99LV7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PigxQ99LV7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PigxQ99LV7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PigxQ99LV7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PigxQ99LV7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PigxQ99LV7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
PigxQ99LV7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PigxQ99LV7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PigxQ99LV7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PigxQ99LV7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PigxQ99LV7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
PigxQ99LV7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PigxQ99LV7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PigxQ99LV7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PigxQ99LV7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PigxQ99LV7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PigxQ99LV7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PigxQ99LV7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PigxQ99LV7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PigxQ99LV7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PigxQ99LV7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PigxQ99LV7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PigxQ99LV7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PigxQ99LV7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
PigxQ99LV7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PigxQ99LV7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PigxQ99LV7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PigxQ99LV7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PigxQ99LV7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PigxQ99LV7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PigxQ99LV7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PigxQ99LV7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PigxQ99LV7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PigxQ99LV7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PigxQ99LV7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
PigxQ99LV7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
PigxQ99LV7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PigxQ99LV7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PigxQ99LV7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PigxQ99LV7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PigxQ99LV7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PigxQ99LV7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PigxQ99LV7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PigxQ99LV7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PigxQ99LV7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PigxQ99LV7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PigxQ99LV7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PigxQ99LV7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PigxQ99LV7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
PigxQ99LV7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PigxQ99LV7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PigxQ99LV7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PigxQ99LV7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PigxQ99LV7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PigxQ99LV7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PigxQ99LV7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PigxQ99LV7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PigxQ99LV7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PigxQ99LV7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PigxQ99LV7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PigxQ99LV7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PigxQ99LV7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PigxQ99LV7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PigxQ99LV7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PigxQ99LV7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PigxQ99LV7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PigxQ99LV7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PigxQ99LV7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PigxQ99LV7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PigxQ99LV7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PigxQ99LV7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PigxQ99LV7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PigxQ99LV7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PigxQ99LV7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PigxQ99LV7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PigxQ99LV7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PigxQ99LV7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PigxQ99LV7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PigxQ99LV7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PigxQ99LV7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms