Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC44.34■■■■■ 4.69
NfiaQ02780 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
NfiaQ02780 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
NfiaQ02780 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
NfiaQ02780 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
NfiaQ02780 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
NfiaQ02780 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
NfiaQ02780 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
NfiaQ02780 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
NfiaQ02780 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
NfiaQ02780 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
NfiaQ02780 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
NfiaQ02780 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
NfiaQ02780 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
NfiaQ02780 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
NfiaQ02780 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
NfiaQ02780 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
NfiaQ02780 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
NfiaQ02780 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.57■■■■□ 3.28
NfiaQ02780 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
NfiaQ02780 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
NfiaQ02780 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
NfiaQ02780 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NfiaQ02780 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
NfiaQ02780 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
NfiaQ02780 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
NfiaQ02780 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NfiaQ02780 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
NfiaQ02780 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NfiaQ02780 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
NfiaQ02780 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
NfiaQ02780 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NfiaQ02780 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
NfiaQ02780 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
NfiaQ02780 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NfiaQ02780 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NfiaQ02780 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
NfiaQ02780 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
NfiaQ02780 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NfiaQ02780 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
NfiaQ02780 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NfiaQ02780 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.79■■■■□ 3
NfiaQ02780 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NfiaQ02780 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
NfiaQ02780 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
NfiaQ02780 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NfiaQ02780 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
NfiaQ02780 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NfiaQ02780 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NfiaQ02780 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
NfiaQ02780 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
NfiaQ02780 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NfiaQ02780 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NfiaQ02780 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NfiaQ02780 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NfiaQ02780 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NfiaQ02780 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
NfiaQ02780 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NfiaQ02780 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NfiaQ02780 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NfiaQ02780 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
NfiaQ02780 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
NfiaQ02780 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
NfiaQ02780 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
NfiaQ02780 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NfiaQ02780 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NfiaQ02780 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NfiaQ02780 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NfiaQ02780 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NfiaQ02780 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NfiaQ02780 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NfiaQ02780 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NfiaQ02780 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
NfiaQ02780 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NfiaQ02780 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NfiaQ02780 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
NfiaQ02780 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NfiaQ02780 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NfiaQ02780 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NfiaQ02780 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NfiaQ02780 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NfiaQ02780 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NfiaQ02780 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NfiaQ02780 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NfiaQ02780 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
NfiaQ02780 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NfiaQ02780 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NfiaQ02780 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NfiaQ02780 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NfiaQ02780 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NfiaQ02780 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
NfiaQ02780 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NfiaQ02780 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NfiaQ02780 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
NfiaQ02780 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
NfiaQ02780 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
NfiaQ02780 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
NfiaQ02780 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
NfiaQ02780 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
NfiaQ02780 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms