RNA–Protein interactions for RNA: YKR018C

YKR018C, Transcript of Protein of unknown function, yeastyeast

Gene YKR018C, Length 2,178 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR018CYKR018C FCP1Q03254 732 aa8.07□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C GYP5Q12344 894 aa8.07□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C CDC6P09119 513 aa8.06□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C RAD57P25301 460 aa8.06□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C ISW1P38144 1129 aa8.06□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C CUE3P53137 624 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C MEC3Q02574 474 aa8.06□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C PKH3Q03306 898 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C NOP6Q07623 225 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C YLR001CQ07895 862 aa8.06□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C NUR1Q12066 484 aa8.06□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C RPL22AP05749 121 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C VPS1P21576 704 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C RAD51P25454 400 aa8.05□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C YSW1P38280 609 aa8.05□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C OSH3P38713 996 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C MRX1P40050 688 aa8.05□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C ALD2P47771 506 aa8.05□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C MSB3P48566 633 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C LSC2P53312 427 aa8.05□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C YNL193WP53870 558 aa8.05□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C RRP6Q12149 733 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C PFK2P16862 959 aaKnown RBP RIP-Chip data8.05□□□□□ -1.12not detected
YKR018CYKR018C SPO12P17123 173 aa8.05□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C PDB1P32473 366 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C EFM2P38347 419 aa8.05□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C UBP16Q02863 499 aa8.05□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C NGL3Q03210 505 aa8.05□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C MDM38Q08179 573 aa8.05□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C RSF2P46974 1380 aa8.04□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C KRS1P15180 591 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C SEC18P18759 758 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C CBP3P21560 335 aa8.04□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C ARG1P22768 420 aa8.04□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C NFU1P32860 256 aa8.04□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C XKS1P42826 600 aa8.04□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C YGR237CP50089 785 aa8.04□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C CDC37P06101 506 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C ARD1P07347 238 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C CNS1P33313 385 aa8.04□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C YKR018CP36114 725 aa8.04□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C AKR1P39010 764 aa8.04□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C CMS1Q07897 291 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C YME2P32843 850 aa8.03□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C CTM1P38818 585 aa8.03□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C SEC26P41810 973 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C SPO11P23179 398 aa8.03□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C CBF5P33322 483 aaKnown RBP RIP-Chip data8.03□□□□□ -1.12not detected
YKR018CYKR018C SKI2P35207 1287 aaKnown RBP RIP-Chip data8.03□□□□□ -1.12not detected
YKR018CYKR018C HFM1P51979 1187 aa8.03□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C UME1Q03010 460 aa8.03□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C YPR204WQ08995 1032 aa8.03□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C GET3Q12154 354 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C GAL11P19659 1081 aa8.02□□□□□ -1.13
YKR018CYKR018C PRP5P21372 849 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
YKR018CYKR018C DPH5P32469 300 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
YKR018CYKR018C TPS3P38426 1054 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
YKR018CYKR018C FYV8P46949 817 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
YKR018CYKR018C TAN1P53072 289 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
YKR018CYKR018C NNF2P53253 936 aa8.02□□□□□ -1.13
YKR018CYKR018C EBS1Q03466 884 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
YKR018CYKR018C SMC6Q12749 1114 aa8.02□□□□□ -1.13
YKR018CYKR018C SAC3P46674 1301 aa8.02□□□□□ -1.13
YKR018CYKR018C JIP3O13555 125 aa8.01□□□□□ -1.13
YKR018CYKR018C CDC8P00572 216 aa8.01□□□□□ -1.13
YKR018CYKR018C SWI4P25302 1093 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
YKR018CYKR018C ZUO1P32527 433 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
YKR018CYKR018C MIP6P38760 659 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
YKR018CYKR018C VPS30Q02948 557 aa8.01□□□□□ -1.13
YKR018CYKR018C YLR287CQ05881 355 aa8.01□□□□□ -1.13
YKR018CYKR018C EST2Q06163 884 aa8.01□□□□□ -1.13
YKR018CYKR018C PTC5Q12511 572 aa8.01□□□□□ -1.13
YKR018CYKR018C TOM70P07213 617 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
YKR018CYKR018C MPH3P0CE00 602 aa8.01□□□□□ -1.13
YKR018CYKR018C GRX7P38068 203 aa8.01□□□□□ -1.13
YKR018CYKR018C OLA1P38219 394 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
YKR018CYKR018C ARG4P04076 463 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
YKR018CYKR018C PIF1P07271 859 aa8□□□□□ -1.13
YKR018CYKR018C TIF4632P39936 914 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
YKR018CYKR018C AIP1P46680 615 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
YKR018CYKR018C SEC5P89102 971 aa8□□□□□ -1.13
YKR018CYKR018C ADA2Q02336 434 aa8□□□□□ -1.13
YKR018CYKR018C SPO19Q03029 223 aa8□□□□□ -1.13
YKR018CYKR018C PKH1Q03407 766 aa8□□□□□ -1.13
YKR018CYKR018C SOV1Q04748 898 aa8□□□□□ -1.13
YKR018CYKR018C EIS1Q05050 843 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
YKR018CYKR018C LCB5Q06147 687 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
YKR018CYKR018C YLR271WQ06152 274 aa8□□□□□ -1.13
YKR018CYKR018C BMH1P29311 267 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
YKR018CYKR018C PSO2P30620 661 aa8□□□□□ -1.13
YKR018CYKR018C PUP2P32379 260 aa8□□□□□ -1.13
YKR018CYKR018C SRB4P32569 687 aa8□□□□□ -1.13
YKR018CYKR018C SEC8P32855 1065 aa8□□□□□ -1.13
YKR018CYKR018C RER2P35196 286 aa8□□□□□ -1.13
YKR018CYKR018C VFA1P40080 203 aa8□□□□□ -1.13
YKR018CYKR018C NCS2P53923 493 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
YKR018CYKR018C UTP5Q04177 643 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
YKR018CYKR018C DPL1Q05567 589 aa8□□□□□ -1.13
YKR018CYKR018C YLR177WQ06251 628 aa8□□□□□ -1.13
YKR018CYKR018C CSC1Q06538 782 aa8□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 25.7 ms