RNA–Protein interactions for RNA: YJL103C

GSM1, Transcript of Putative zinc cluster protein of unknown function, yeast

Gene GSM1, Length 1,857 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GSM1	YJL103C	APN1	P22936	367 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	SUV3	P32580	737 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	IRC3	Q06683	689 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	WTM2	Q12206	467 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	HAT1	Q12341	374 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	RKM4	Q12504	494 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	COY1	P34237	679 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	RXT2	P38255	430 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	EFM2	P38347	419 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	YTA6	P40328	754 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
GSM1	YJL103C	YNL050C	P53952	270 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	ATG26	Q06321	1198 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	BDS1	Q08347	646 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	FOB1	O13329	566 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	CYT1	P07143	309 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	SPS1	P08458	490 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	KAR3	P17119	729 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	VAN1	P23642	535 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	IME2	P32581	645 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	GRX4	P32642	244 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	MEF2	P39677	819 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	KAR5	Q04746	504 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	ARV1	Q06541	321 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	TCB3	Q03640	1545 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	HOM3	P10869	527 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	AFT1	P22149	690 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	PSO2	P30620	661 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	JNM1	P36224	373 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	PNP1	Q05788	311 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	ORM2	Q06144	216 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	LSO1	Q3E827	93 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	INH1	P01097	85 aa		4.9	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	SRS2	P12954	1174 aa		4.9	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	BUD14	P27637	709 aa		4.9	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	ASH1	P34233	588 aa		4.9	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	ATG19	P35193	415 aa		4.9	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	TBS1	P38114	1094 aa		4.9	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	ALG12	P53730	551 aa		4.9	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	PUN1	Q06991	263 aa		4.9	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	MDM38	Q08179	573 aa		4.9	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	SKI3	P17883	1432 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GSM1	YJL103C	HNM1	P19807	563 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GSM1	YJL103C	HIR2	P32480	875 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GSM1	YJL103C	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GSM1	YJL103C	YAP1801	P38856	637 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GSM1	YJL103C	MSB3	P48566	633 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GSM1	YJL103C	HEH2	Q03281	663 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GSM1	YJL103C	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GSM1	YJL103C	YPQ2	Q06328	317 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GSM1	YJL103C	PMT7	Q06644	662 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GSM1	YJL103C	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
GSM1	YJL103C	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GSM1	YJL103C	BOL3	P39724	118 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GSM1	YJL103C	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GSM1	YJL103C	IRR1	P40541	1150 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GSM1	YJL103C	BTN2	P53286	410 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GSM1	YJL103C	DSL1	P53847	754 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GSM1	YJL103C	SNZ1	Q03148	297 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GSM1	YJL103C	YDR338C	Q05497	695 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GSM1	YJL103C	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GSM1	YJL103C	ACE2	P21192	770 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GSM1	YJL103C	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
GSM1	YJL103C	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GSM1	YJL103C	APE4	P38821	490 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GSM1	YJL103C	LAM1	P38851	1228 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GSM1	YJL103C	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GSM1	YJL103C	MAM1	P40065	302 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GSM1	YJL103C	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GSM1	YJL103C	YML119W	Q03208	357 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GSM1	YJL103C	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GSM1	YJL103C	RNH1	Q04740	348 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GSM1	YJL103C	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GSM1	YJL103C	ENT1	Q12518	454 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GSM1	YJL103C	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GSM1	YJL103C	MRPL25	P23369	157 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GSM1	YJL103C	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GSM1	YJL103C	AAD3	P25612	363 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GSM1	YJL103C	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GSM1	YJL103C	MRE11	P32829	692 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GSM1	YJL103C	EXO84	P38261	753 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GSM1	YJL103C	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63

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