RNA–Protein interactions for RNA: YDL117W

CYK3, Transcript of SH3-domain protein located in the bud neck and cytokinetic actin ring, yeastyeast

Gene CYK3, Length 2,658 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CYK3YDL117W SEC8P32855 1065 aa5.62□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W STN1P38960 494 aa5.62□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W VAM6Q07468 1049 aa5.62□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W SSM4P40318 1319 aa5.62□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W SSB1P11484 613 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W TPM1P17536 199 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W CPS1P27614 576 aa5.62□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W PLC1P32383 869 aa5.62□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W RTS1P38903 757 aa5.62□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W SSB2P40150 613 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W RIC1P40395 1056 aa5.62□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W PLP1Q04004 230 aa5.62□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W AIM7Q12156 149 aa5.62□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W SUI3P09064 285 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W HNM1P19807 563 aa5.61□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W BMH2P34730 273 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W MRP8P35719 219 aa5.61□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W GCD10P41814 478 aa5.61□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W VPS70P47161 811 aa5.61□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W EFM5P53200 248 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W DBP9Q06218 594 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data5.61□□□□□ -1.51not detected
CYK3YDL117W STE6P12866 1290 aa5.61□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W HSP104P31539 908 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W RTG2P32608 588 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W GLC3P32775 704 aa5.61□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W PTR2P32901 601 aa5.61□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W LHS1P36016 881 aa5.61□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W SAK1P38990 1142 aa5.61□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W CAF130P53280 1122 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W SPP382Q06411 708 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W YKL068W-AQ3E826 78 aa5.61□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W ARD1P07347 238 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W OCA4P25366 362 aa5.61□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W MIC60P36112 540 aa5.61□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W RSM25P40496 264 aa5.61□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W YJR142WP47173 342 aa5.61□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W ECL1P48235 211 aa5.61□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W COP1P53622 1201 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W RNH1Q04740 348 aa5.61□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W RSA3Q05942 220 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W SPN1Q06505 410 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W YPL277CQ08989 487 aa5.61□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W LSO2Q3E772 92 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W YRF1-4O13559 1382 aa5.6□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W YML133CQ03099 1374 aa5.6□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W YLL067CQ07888 1374 aa5.6□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W YLL066CQ99208 1374 aa5.6□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W ESP1Q03018 1630 aa5.6□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W SSC1P0CS90 654 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W PMS1P14242 873 aa5.6□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W RPN2P32565 945 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W HCS1P34243 683 aa5.6□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W PBY1P38254 753 aa5.6□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W DIP5P53388 608 aa5.6□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W LCB5Q06147 687 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W ANP1P32629 500 aa5.6□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W TFC3P34111 1160 aa5.6□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W SRL3P36167 246 aa5.6□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W DAS1P47005 663 aa5.6□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W CWH41P53008 833 aa5.6□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W ULP1Q02724 621 aa5.6□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W RPN4Q03465 531 aa5.6□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W BDF2Q07442 638 aa5.6□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W NOT5Q12514 560 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W PRT1P06103 763 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W HIS3P06633 220 aa5.59□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W ADH4P10127 382 aa5.59□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W SLA1P32790 1244 aa5.59□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W MIA40P36046 403 aa5.59□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W UIP5P36137 443 aa5.59□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W TAF5P38129 798 aa5.59□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W SYG1P40528 902 aa5.59□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W PHB1P40961 287 aa5.59□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W MET12P46151 657 aa5.59□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W MET5P47169 1442 aa5.59□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W RIM21P48565 533 aa5.59□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W ATG38Q05789 226 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W CMS1Q07897 291 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W RRP36Q12481 300 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
CYK3YDL117W TEF1P02994 458 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W CYC8P14922 966 aa5.59□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W MRC1P25588 1096 aa5.59□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W SLX1P38324 304 aa5.59□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W STM1P39015 273 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W ESL1P40456 1118 aa5.59□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W TIM54P47045 478 aa5.59□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W BET4Q00618 327 aa5.59□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W HAP5Q02516 242 aa5.59□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W NSE3Q05541 303 aa5.59□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W MMR1Q06324 491 aa5.59□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W KAR1P11927 433 aa5.58□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W HSP78P33416 811 aa5.58□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W MNR2P35724 969 aa5.58□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W SIP3P38717 1229 aa5.58□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W BFR1P38934 470 aaKnown RBP RIP-Chip data5.58□□□□□ -1.52not detected
CYK3YDL117W VID28P40547 921 aa5.58□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W SNX4P47057 423 aa5.58□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W HPC2Q01448 625 aa5.58□□□□□ -1.52
CYK3YDL117W TAF8Q03750 510 aa5.58□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 74.8 ms