RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504994.1

HERC3-209, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 341 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-209ENST00000504994 CCNYL3P0C7X3 344 aa7.89□□□□□ -1.15
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HERC3-209ENST00000504994 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
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HERC3-209ENST00000504994 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP7.88□□□□□ -1.15
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HERC3-209ENST00000504994 ATP1A2P50993 1020 aa7.87□□□□□ -1.15
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HERC3-209ENST00000504994 LARGE2Q8N3Y3 721 aa7.86□□□□□ -1.15
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HERC3-209ENST00000504994 NUDT12Q9BQG2 462 aa7.86□□□□□ -1.15
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HERC3-209ENST00000504994 PRDM9Q9NQV7 894 aa7.85□□□□□ -1.15
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HERC3-209ENST00000504994 HPS5Q9UPZ3 1129 aa7.82□□□□□ -1.16
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HERC3-209ENST00000504994 BCAMP50895 628 aa7.8□□□□□ -1.16
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HERC3-209ENST00000504994 ASB16Q96NS5 453 aa7.8□□□□□ -1.16
HERC3-209ENST00000504994 MKNK1Q9BUB5 465 aa7.8□□□□□ -1.16
HERC3-209ENST00000504994 CARD14Q9BXL6 1004 aa7.8□□□□□ -1.16
HERC3-209ENST00000504994 UNC93B1Q9H1C4 597 aa7.8□□□□□ -1.16
HERC3-209ENST00000504994 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa7.8□□□□□ -1.16
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HERC3-209ENST00000504994 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa7.77□□□□□ -1.17
HERC3-209ENST00000504994 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
HERC3-209ENST00000504994 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
HERC3-209ENST00000504994 HRO43593 1189 aa7.76□□□□□ -1.17
HERC3-209ENST00000504994 WEE1P30291 646 aa7.76□□□□□ -1.17
HERC3-209ENST00000504994 ERFEQ4G0M1 354 aa7.76□□□□□ -1.17
HERC3-209ENST00000504994 ADGRD1Q6QNK2 874 aa7.76□□□□□ -1.17
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