RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443528.5

ACTB-206, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-206ENST00000443528 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
ACTB-206ENST00000443528 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-206ENST00000443528 PANK3Q9H999 370 aa21.74■■□□□ 1.07
ACTB-206ENST00000443528 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
ACTB-206ENST00000443528 SEPT12Q8IYM1 358 aa21.73■■□□□ 1.07
ACTB-206ENST00000443528 FBLN1P23142 703 aa21.72■■□□□ 1.07
ACTB-206ENST00000443528 ABCC6O95255 1503 aa21.71■■□□□ 1.07
ACTB-206ENST00000443528 USP35Q9P2H5 1018 aa21.7■■□□□ 1.06
ACTB-206ENST00000443528 KIF20BQ96Q89 1820 aa21.7■■□□□ 1.06
ACTB-206ENST00000443528 CGNL1Q0VF96 1302 aa21.69■■□□□ 1.06
ACTB-206ENST00000443528 CRB1P82279 1406 aa21.69■■□□□ 1.06
ACTB-206ENST00000443528 MAP3K19Q56UN5 1328 aa21.68■■□□□ 1.06
ACTB-206ENST00000443528 WDR17Q8IZU2 1322 aa21.68■■□□□ 1.06
ACTB-206ENST00000443528 LTN1O94822 1766 aa21.68■■□□□ 1.06
ACTB-206ENST00000443528 RGPD5Q99666 1765 aa21.68■■□□□ 1.06
ACTB-206ENST00000443528 CCDC7Q96M83 1385 aa21.67■■□□□ 1.06
ACTB-206ENST00000443528 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.67■■□□□ 1.06
ACTB-206ENST00000443528 BARGINQ6ZT62 677 aa21.67■■□□□ 1.06
ACTB-206ENST00000443528 TCP11L2Q8N4U5 519 aa21.67■■□□□ 1.06
ACTB-206ENST00000443528 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP21.67■■□□□ 1.06
ACTB-206ENST00000443528 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa21.66■■□□□ 1.06
ACTB-206ENST00000443528 IP6K1Q92551 441 aa21.66■■□□□ 1.06
ACTB-206ENST00000443528 BRWD3Q6RI45 1802 aa21.65■■□□□ 1.06
ACTB-206ENST00000443528 A0A0G2JS52 829 aa21.65■■□□□ 1.06
ACTB-206ENST00000443528 MYT1Q01538 1121 aa21.65■■□□□ 1.06
ACTB-206ENST00000443528 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
ACTB-206ENST00000443528 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa21.65■■□□□ 1.06
ACTB-206ENST00000443528 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
ACTB-206ENST00000443528 ERBB3P21860 1342 aa21.64■■□□□ 1.05
ACTB-206ENST00000443528 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa21.63■■□□□ 1.05
ACTB-206ENST00000443528 HOXC9P31274 260 aa21.63■■□□□ 1.05
ACTB-206ENST00000443528 KRT27Q7Z3Y8 459 aa21.63■■□□□ 1.05
ACTB-206ENST00000443528 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
ACTB-206ENST00000443528 ANKRD24Q8TF21 1146 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTB-206ENST00000443528 CARD10Q9BWT7 1032 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTB-206ENST00000443528 AMPHP49418 695 aa21.61■■□□□ 1.05
ACTB-206ENST00000443528 RTL1A6NKG5 1358 aa21.6■■□□□ 1.05
ACTB-206ENST00000443528 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
ACTB-206ENST00000443528 KNSTRNQ9Y448 316 aa21.59■■□□□ 1.05
ACTB-206ENST00000443528 EP400Q96L91 3159 aa21.59■■□□□ 1.05
ACTB-206ENST00000443528 NSD2O96028 1365 aa21.58■■□□□ 1.04
ACTB-206ENST00000443528 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
ACTB-206ENST00000443528 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
ACTB-206ENST00000443528 NLRP2Q9NX02 1062 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-206ENST00000443528 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-206ENST00000443528 PEAK1Q9H792 1746 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-206ENST00000443528 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-206ENST00000443528 FAM182BQ5T319 152 aa21.56■■□□□ 1.04
ACTB-206ENST00000443528 DISP2A7MBM2 1401 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-206ENST00000443528 KIF24Q5T7B8 1368 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-206ENST00000443528 FLT4P35916 1363 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTB-206ENST00000443528 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
ACTB-206ENST00000443528 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTB-206ENST00000443528 POLKQ9UBT6 870 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTB-206ENST00000443528 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
ACTB-206ENST00000443528 INSRP06213 1382 aa21.53■■□□□ 1.04
ACTB-206ENST00000443528 MORC1Q86VD1 984 aa21.52■■□□□ 1.04
ACTB-206ENST00000443528 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
ACTB-206ENST00000443528 WNK3Q9BYP7 1800 aa21.52■■□□□ 1.04
ACTB-206ENST00000443528 PDE3BQ13370 1112 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTB-206ENST00000443528 LRRC37A3O60309 1634 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTB-206ENST00000443528 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
ACTB-206ENST00000443528 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
ACTB-206ENST00000443528 DDB1Q16531 1140 aa21.5■■□□□ 1.03
ACTB-206ENST00000443528 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
ACTB-206ENST00000443528 NBPF6Q5VWK0 638 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTB-206ENST00000443528 CCDC125Q86Z20 511 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTB-206ENST00000443528 NBPF4Q96M43 638 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTB-206ENST00000443528 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
ACTB-206ENST00000443528 IL2RBP14784 551 aa21.48■■□□□ 1.03
ACTB-206ENST00000443528 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
ACTB-206ENST00000443528 RGPD2P0DJD1 1756 aa21.46■■□□□ 1.03
ACTB-206ENST00000443528 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
ACTB-206ENST00000443528 FAM196AQ6ZSG2 479 aa21.46■■□□□ 1.03
ACTB-206ENST00000443528 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa21.46■■□□□ 1.03
ACTB-206ENST00000443528 EXOC5O00471 708 aa21.45■■□□□ 1.02
ACTB-206ENST00000443528 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
ACTB-206ENST00000443528 USHBP1Q8N6Y0 703 aa21.44■■□□□ 1.02
ACTB-206ENST00000443528 TNS2Q63HR2 1409 aa21.44■■□□□ 1.02
ACTB-206ENST00000443528 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa21.41■■□□□ 1.02
ACTB-206ENST00000443528 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
ACTB-206ENST00000443528 MEGF6O75095 1541 aa21.4■■□□□ 1.02
ACTB-206ENST00000443528 TRIM37O94972 964 aa21.4■■□□□ 1.02
ACTB-206ENST00000443528 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
ACTB-206ENST00000443528 NCAPD2Q15021 1401 aa21.39■■□□□ 1.02
ACTB-206ENST00000443528 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
ACTB-206ENST00000443528 DEFB132Q7Z7B7 95 aa21.39■■□□□ 1.01
ACTB-206ENST00000443528 EYA1Q99502 592 aa21.39■■□□□ 1.01
ACTB-206ENST00000443528 BCL9O00512 1426 aa21.38■■□□□ 1.01
ACTB-206ENST00000443528 RGPD1P0DJD0 1748 aa21.37■■□□□ 1.01
ACTB-206ENST00000443528 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
ACTB-206ENST00000443528 MTHFSP49914 203 aa21.36■■□□□ 1.01
ACTB-206ENST00000443528 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa21.35■■□□□ 1.01
ACTB-206ENST00000443528 BAG6P46379 1132 aa21.34■■□□□ 1.01
ACTB-206ENST00000443528 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
ACTB-206ENST00000443528 TATP17735 454 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
ACTB-206ENST00000443528 PTF1AQ7RTS3 328 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-206ENST00000443528 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
ACTB-206ENST00000443528 IGSF1Q8N6C5 1336 aa21.32■■□□□ 1
ACTB-206ENST00000443528 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
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