RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404287.2

MESTP1-201, Transcript of mesoderm specific transcript pseudogene 1, humanhuman

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Gene MESTP1, Length 994 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESTP1-201ENST00000404287 COG3Q96JB2 828 aa26.71■■□□□ 1.87
MESTP1-201ENST00000404287 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
MESTP1-201ENST00000404287 KIF20BQ96Q89 1820 aa26.7■■□□□ 1.87
MESTP1-201ENST00000404287 PANK3Q9H999 370 aa26.7■■□□□ 1.86
MESTP1-201ENST00000404287 FBLN1P23142 703 aa26.69■■□□□ 1.86
MESTP1-201ENST00000404287 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa26.67■■□□□ 1.86
MESTP1-201ENST00000404287 LTN1O94822 1766 aa26.67■■□□□ 1.86
MESTP1-201ENST00000404287 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.66■■□□□ 1.86
MESTP1-201ENST00000404287 RGPD5Q99666 1765 aa26.66■■□□□ 1.86
MESTP1-201ENST00000404287 EVA1CP58658 441 aa26.66■■□□□ 1.86
MESTP1-201ENST00000404287 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
MESTP1-201ENST00000404287 SEPT12Q8IYM1 358 aa26.66■■□□□ 1.86
MESTP1-201ENST00000404287 CCDC7Q96M83 1385 aa26.66■■□□□ 1.86
MESTP1-201ENST00000404287 CRB1P82279 1406 aa26.64■■□□□ 1.85
MESTP1-201ENST00000404287 MAP3K19Q56UN5 1328 aa26.64■■□□□ 1.85
MESTP1-201ENST00000404287 BRWD3Q6RI45 1802 aa26.63■■□□□ 1.85
MESTP1-201ENST00000404287 WDR17Q8IZU2 1322 aa26.63■■□□□ 1.85
MESTP1-201ENST00000404287 EP400Q96L91 3159 aa26.62■■□□□ 1.85
MESTP1-201ENST00000404287 CGNL1Q0VF96 1302 aa26.62■■□□□ 1.85
MESTP1-201ENST00000404287 BARGINQ6ZT62 677 aa26.6■■□□□ 1.85
MESTP1-201ENST00000404287 IP6K1Q92551 441 aa26.6■■□□□ 1.85
MESTP1-201ENST00000404287 USP35Q9P2H5 1018 aa26.6■■□□□ 1.85
MESTP1-201ENST00000404287 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
MESTP1-201ENST00000404287 TCP11L2Q8N4U5 519 aa26.59■■□□□ 1.85
MESTP1-201ENST00000404287 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP26.59■■□□□ 1.85
MESTP1-201ENST00000404287 ERBB3P21860 1342 aa26.59■■□□□ 1.85
MESTP1-201ENST00000404287 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
MESTP1-201ENST00000404287 HOXC9P31274 260 aa26.57■■□□□ 1.84
MESTP1-201ENST00000404287 PEAK1Q9H792 1746 aa26.56■■□□□ 1.84
MESTP1-201ENST00000404287 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
MESTP1-201ENST00000404287 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
MESTP1-201ENST00000404287 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa26.56■■□□□ 1.84
MESTP1-201ENST00000404287 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa26.55■■□□□ 1.84
MESTP1-201ENST00000404287 CARD10Q9BWT7 1032 aa26.54■■□□□ 1.84
MESTP1-201ENST00000404287 RTL1A6NKG5 1358 aa26.54■■□□□ 1.84
MESTP1-201ENST00000404287 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
MESTP1-201ENST00000404287 KRT27Q7Z3Y8 459 aa26.53■■□□□ 1.84
MESTP1-201ENST00000404287 ANKRD24Q8TF21 1146 aa26.53■■□□□ 1.84
MESTP1-201ENST00000404287 DISP2A7MBM2 1401 aa26.52■■□□□ 1.84
MESTP1-201ENST00000404287 NSD2O96028 1365 aa26.51■■□□□ 1.83
MESTP1-201ENST00000404287 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa26.51■■□□□ 1.83
MESTP1-201ENST00000404287 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa26.51■■□□□ 1.83
MESTP1-201ENST00000404287 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
MESTP1-201ENST00000404287 A0A0G2JS52 829 aa26.5■■□□□ 1.83
MESTP1-201ENST00000404287 AMPHP49418 695 aa26.5■■□□□ 1.83
MESTP1-201ENST00000404287 MYT1Q01538 1121 aa26.5■■□□□ 1.83
MESTP1-201ENST00000404287 WNK3Q9BYP7 1800 aa26.5■■□□□ 1.83
MESTP1-201ENST00000404287 KIF24Q5T7B8 1368 aa26.49■■□□□ 1.83
MESTP1-201ENST00000404287 KNSTRNQ9Y448 316 aa26.48■■□□□ 1.83
MESTP1-201ENST00000404287 POLKQ9UBT6 870 aa26.47■■□□□ 1.83
MESTP1-201ENST00000404287 LRRC37A3O60309 1634 aa26.47■■□□□ 1.83
MESTP1-201ENST00000404287 FLT4P35916 1363 aa26.46■■□□□ 1.83
MESTP1-201ENST00000404287 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa26.46■■□□□ 1.83
MESTP1-201ENST00000404287 FAM182BQ5T319 152 aa26.46■■□□□ 1.83
MESTP1-201ENST00000404287 INSRP06213 1382 aa26.46■■□□□ 1.83
MESTP1-201ENST00000404287 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
MESTP1-201ENST00000404287 NLRP2Q9NX02 1062 aa26.45■■□□□ 1.82
MESTP1-201ENST00000404287 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
MESTP1-201ENST00000404287 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
MESTP1-201ENST00000404287 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
MESTP1-201ENST00000404287 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
MESTP1-201ENST00000404287 RGPD2P0DJD1 1756 aa26.41■■□□□ 1.82
MESTP1-201ENST00000404287 NBPF6Q5VWK0 638 aa26.4■■□□□ 1.82
MESTP1-201ENST00000404287 NBPF4Q96M43 638 aa26.4■■□□□ 1.82
MESTP1-201ENST00000404287 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
MESTP1-201ENST00000404287 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa26.4■■□□□ 1.82
MESTP1-201ENST00000404287 MORC1Q86VD1 984 aa26.39■■□□□ 1.82
MESTP1-201ENST00000404287 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
MESTP1-201ENST00000404287 DDB1Q16531 1140 aa26.37■■□□□ 1.81
MESTP1-201ENST00000404287 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
MESTP1-201ENST00000404287 PDE3BQ13370 1112 aa26.36■■□□□ 1.81
MESTP1-201ENST00000404287 IL2RBP14784 551 aa26.35■■□□□ 1.81
MESTP1-201ENST00000404287 NCAPD2Q15021 1401 aa26.35■■□□□ 1.81
MESTP1-201ENST00000404287 TNS2Q63HR2 1409 aa26.35■■□□□ 1.81
MESTP1-201ENST00000404287 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
MESTP1-201ENST00000404287 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
MESTP1-201ENST00000404287 CCDC125Q86Z20 511 aa26.33■■□□□ 1.81
MESTP1-201ENST00000404287 USHBP1Q8N6Y0 703 aa26.33■■□□□ 1.81
MESTP1-201ENST00000404287 MEGF6O75095 1541 aa26.33■■□□□ 1.81
MESTP1-201ENST00000404287 FAM196AQ6ZSG2 479 aa26.32■■□□□ 1.8
MESTP1-201ENST00000404287 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
MESTP1-201ENST00000404287 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa26.3■■□□□ 1.8
MESTP1-201ENST00000404287 BCL9O00512 1426 aa26.3■■□□□ 1.8
MESTP1-201ENST00000404287 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
MESTP1-201ENST00000404287 EXOC5O00471 708 aa26.29■■□□□ 1.8
MESTP1-201ENST00000404287 EYA1Q99502 592 aa26.28■■□□□ 1.8
MESTP1-201ENST00000404287 DEFB132Q7Z7B7 95 aa26.26■■□□□ 1.79
MESTP1-201ENST00000404287 RGPD1P0DJD0 1748 aa26.25■■□□□ 1.79
MESTP1-201ENST00000404287 SHANK3Q9BYB0 1731 aa26.25■■□□□ 1.79
MESTP1-201ENST00000404287 TRIM37O94972 964 aa26.25■■□□□ 1.79
MESTP1-201ENST00000404287 MTHFSP49914 203 aa26.23■■□□□ 1.79
MESTP1-201ENST00000404287 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
MESTP1-201ENST00000404287 PTF1AQ7RTS3 328 aa26.22■■□□□ 1.79
MESTP1-201ENST00000404287 SBF2Q86WG5 1849 aa26.22■■□□□ 1.79
MESTP1-201ENST00000404287 IGSF1Q8N6C5 1336 aa26.21■■□□□ 1.79
MESTP1-201ENST00000404287 IL13P35225 146 aa26.2■■□□□ 1.78
MESTP1-201ENST00000404287 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
MESTP1-201ENST00000404287 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
MESTP1-201ENST00000404287 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa26.18■■□□□ 1.78
MESTP1-201ENST00000404287 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
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