RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390930.1

SNORD17-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 17, humanhuman

BASIC

Gene SNORD17, Length 237 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD17-201ENST00000390930 PANK3Q9H999 370 aa4.84□□□□□ -1.63
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SNORD17-201ENST00000390930 ZBTB7CA1YPR0 619 aa4.83□□□□□ -1.64
SNORD17-201ENST00000390930 CDCA8Q53HL2 280 aa4.83□□□□□ -1.64
SNORD17-201ENST00000390930 KCNH5Q8NCM2 988 aa4.83□□□□□ -1.64
SNORD17-201ENST00000390930 STRN4Q9NRL3 753 aa4.83□□□□□ -1.64
SNORD17-201ENST00000390930 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
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SNORD17-201ENST00000390930 MAP3K19Q56UN5 1328 aa4.82□□□□□ -1.64
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SNORD17-201ENST00000390930 IP6K1Q92551 441 aa4.81□□□□□ -1.64
SNORD17-201ENST00000390930 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP4.81□□□□□ -1.64
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SNORD17-201ENST00000390930 USP35Q9P2H5 1018 aa4.81□□□□□ -1.64
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SNORD17-201ENST00000390930 ABCC6O95255 1503 aa4.81□□□□□ -1.64
SNORD17-201ENST00000390930 CRB1P82279 1406 aa4.8□□□□□ -1.64
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SNORD17-201ENST00000390930 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa4.8□□□□□ -1.64
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SNORD17-201ENST00000390930 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa4.8□□□□□ -1.64
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SNORD17-201ENST00000390930 DISP2A7MBM2 1401 aa4.8□□□□□ -1.64
SNORD17-201ENST00000390930 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
SNORD17-201ENST00000390930 CGNL1Q0VF96 1302 aa4.79□□□□□ -1.64
SNORD17-201ENST00000390930 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa4.79□□□□□ -1.64
SNORD17-201ENST00000390930 KRT27Q7Z3Y8 459 aa4.79□□□□□ -1.64
SNORD17-201ENST00000390930 ANKRD24Q8TF21 1146 aa4.79□□□□□ -1.64
SNORD17-201ENST00000390930 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
SNORD17-201ENST00000390930 CARD10Q9BWT7 1032 aa4.79□□□□□ -1.64
SNORD17-201ENST00000390930 POLKQ9UBT6 870 aa4.79□□□□□ -1.64
SNORD17-201ENST00000390930 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
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SNORD17-201ENST00000390930 SHANK3Q9BYB0 1731 aa4.78□□□□□ -1.64
SNORD17-201ENST00000390930 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
SNORD17-201ENST00000390930 AMPHP49418 695 aa4.78□□□□□ -1.64
SNORD17-201ENST00000390930 NBPF6Q5VWK0 638 aa4.78□□□□□ -1.64
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SNORD17-201ENST00000390930 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa4.77□□□□□ -1.65
SNORD17-201ENST00000390930 MYT1Q01538 1121 aa4.77□□□□□ -1.65
SNORD17-201ENST00000390930 PTF1AQ7RTS3 328 aa4.77□□□□□ -1.65
SNORD17-201ENST00000390930 USHBP1Q8N6Y0 703 aa4.77□□□□□ -1.65
SNORD17-201ENST00000390930 NLRP2Q9NX02 1062 aa4.77□□□□□ -1.65
SNORD17-201ENST00000390930 KNSTRNQ9Y448 316 aa4.77□□□□□ -1.65
SNORD17-201ENST00000390930 NCAPD2Q15021 1401 aa4.77□□□□□ -1.65
SNORD17-201ENST00000390930 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
SNORD17-201ENST00000390930 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
SNORD17-201ENST00000390930 NSD2O96028 1365 aa4.77□□□□□ -1.65
SNORD17-201ENST00000390930 FLT4P35916 1363 aa4.77□□□□□ -1.65
SNORD17-201ENST00000390930 KIF24Q5T7B8 1368 aa4.77□□□□□ -1.65
SNORD17-201ENST00000390930 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa4.77□□□□□ -1.65
SNORD17-201ENST00000390930 MEGF6O75095 1541 aa4.77□□□□□ -1.65
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SNORD17-201ENST00000390930 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
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SNORD17-201ENST00000390930 DDB1Q16531 1140 aa4.76□□□□□ -1.65
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SNORD17-201ENST00000390930 DEFB132Q7Z7B7 95 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD17-201ENST00000390930 MORC1Q86VD1 984 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD17-201ENST00000390930 EYA1Q99502 592 aa4.76□□□□□ -1.65
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SNORD17-201ENST00000390930 RGPD1P0DJD0 1748 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD17-201ENST00000390930 TNS2Q63HR2 1409 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD17-201ENST00000390930 TRIM37O94972 964 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD17-201ENST00000390930 IL2RBP14784 551 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD17-201ENST00000390930 IL13P35225 146 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD17-201ENST00000390930 MTHFSP49914 203 aa4.75□□□□□ -1.65
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SNORD17-201ENST00000390930 BCL9O00512 1426 aa4.74□□□□□ -1.65
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SNORD17-201ENST00000390930 KCNQ2O43526 872 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD17-201ENST00000390930 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
SNORD17-201ENST00000390930 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
SNORD17-201ENST00000390930 PDE3BQ13370 1112 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD17-201ENST00000390930 FAM196AQ6ZSG2 479 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD17-201ENST00000390930 CCDC125Q86Z20 511 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD17-201ENST00000390930 AEBP1Q8IUX7 1158 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD17-201ENST00000390930 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
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