RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345015.4

KCNQ1-203, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene KCNQ1, Length 304 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-203ENST00000345015 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
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KCNQ1-203ENST00000345015 WDR17Q8IZU2 1322 aa16.79■□□□□ 0.28
KCNQ1-203ENST00000345015 ZRANB1Q9UGI0 708 aa16.79■□□□□ 0.28
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KCNQ1-203ENST00000345015 KIF20BQ96Q89 1820 aa16.79■□□□□ 0.28
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KCNQ1-203ENST00000345015 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa16.77■□□□□ 0.27
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KCNQ1-203ENST00000345015 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
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KCNQ1-203ENST00000345015 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
KCNQ1-203ENST00000345015 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa16.71■□□□□ 0.27
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KCNQ1-203ENST00000345015 NLRP2Q9NX02 1062 aa16.63■□□□□ 0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 WNK3Q9BYP7 1800 aa16.62■□□□□ 0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 IL2RBP14784 551 aa16.62■□□□□ 0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 DDB1Q16531 1140 aa16.62■□□□□ 0.25
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KCNQ1-203ENST00000345015 NCAPD2Q15021 1401 aa16.61■□□□□ 0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 PEAK1Q9H792 1746 aa16.6■□□□□ 0.25
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KCNQ1-203ENST00000345015 FBLN1P23142 703 aa16.6■□□□□ 0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa16.6■□□□□ 0.25
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KCNQ1-203ENST00000345015 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa16.58■□□□□ 0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 LRRC37A3O60309 1634 aa16.57■□□□□ 0.24
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KCNQ1-203ENST00000345015 NBPF4Q96M43 638 aa16.56■□□□□ 0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP16.56■□□□□ 0.24
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KCNQ1-203ENST00000345015 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa16.54■□□□□ 0.24
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KCNQ1-203ENST00000345015 RGPD1P0DJD0 1748 aa16.53■□□□□ 0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 IGSF1Q8N6C5 1336 aa16.52■□□□□ 0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
KCNQ1-203ENST00000345015 TATP17735 454 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
KCNQ1-203ENST00000345015 MTHFSP49914 203 aa16.51■□□□□ 0.23
KCNQ1-203ENST00000345015 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
KCNQ1-203ENST00000345015 EYA1Q99502 592 aa16.51■□□□□ 0.23
KCNQ1-203ENST00000345015 BAG6P46379 1132 aa16.5■□□□□ 0.23
KCNQ1-203ENST00000345015 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
KCNQ1-203ENST00000345015 KDRP35968 1356 aa16.5■□□□□ 0.23
KCNQ1-203ENST00000345015 RGPD2P0DJD1 1756 aa16.49■□□□□ 0.23
KCNQ1-203ENST00000345015 IL13P35225 146 aa16.49■□□□□ 0.23
KCNQ1-203ENST00000345015 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa16.48■□□□□ 0.23
KCNQ1-203ENST00000345015 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa16.48■□□□□ 0.23
KCNQ1-203ENST00000345015 RALBP1Q15311 655 aa16.48■□□□□ 0.23
KCNQ1-203ENST00000345015 MEGF6O75095 1541 aa16.48■□□□□ 0.23
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