RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270560.3

TM4SF5-201, Transcript of transmembrane 4 L six family member 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TM4SF5, Length 708 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF5-201ENST00000270560 AXIN2Q9Y2T1 843 aa28.61■■■□□ 2.17
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TM4SF5-201ENST00000270560 CCDC7Q96M83 1385 aa28.56■■■□□ 2.16
TM4SF5-201ENST00000270560 COL18A1P39060 1754 aa28.55■■■□□ 2.16
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TM4SF5-201ENST00000270560 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa28.5■■■□□ 2.15
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TM4SF5-201ENST00000270560 KIF20BQ96Q89 1820 aa28.49■■■□□ 2.15
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TM4SF5-201ENST00000270560 CARD10Q9BWT7 1032 aa28.46■■■□□ 2.15
TM4SF5-201ENST00000270560 RTL1A6NKG5 1358 aa28.46■■■□□ 2.15
TM4SF5-201ENST00000270560 ANKRD24Q8TF21 1146 aa28.45■■■□□ 2.14
TM4SF5-201ENST00000270560 KRT27Q7Z3Y8 459 aa28.44■■■□□ 2.14
TM4SF5-201ENST00000270560 LTN1O94822 1766 aa28.44■■■□□ 2.14
TM4SF5-201ENST00000270560 KIF24Q5T7B8 1368 aa28.43■■■□□ 2.14
TM4SF5-201ENST00000270560 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
TM4SF5-201ENST00000270560 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa28.42■■■□□ 2.14
TM4SF5-201ENST00000270560 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
TM4SF5-201ENST00000270560 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP28.41■■■□□ 2.14
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TM4SF5-201ENST00000270560 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
TM4SF5-201ENST00000270560 FLT4P35916 1363 aa28.38■■■□□ 2.13
TM4SF5-201ENST00000270560 MORC1Q86VD1 984 aa28.37■■■□□ 2.13
TM4SF5-201ENST00000270560 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
TM4SF5-201ENST00000270560 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa28.37■■■□□ 2.13
TM4SF5-201ENST00000270560 RGPD5Q99666 1765 aa28.36■■■□□ 2.13
TM4SF5-201ENST00000270560 INSRP06213 1382 aa28.36■■■□□ 2.13
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TM4SF5-201ENST00000270560 POLKQ9UBT6 870 aa28.35■■■□□ 2.13
TM4SF5-201ENST00000270560 PDE3BQ13370 1112 aa28.34■■■□□ 2.13
TM4SF5-201ENST00000270560 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa28.34■■■□□ 2.13
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TM4SF5-201ENST00000270560 PEAK1Q9H792 1746 aa28.28■■■□□ 2.12
TM4SF5-201ENST00000270560 IL2RBP14784 551 aa28.27■■■□□ 2.12
TM4SF5-201ENST00000270560 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
TM4SF5-201ENST00000270560 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.12
TM4SF5-201ENST00000270560 FAM182BQ5T319 152 aa28.26■■■□□ 2.11
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TM4SF5-201ENST00000270560 EP400Q96L91 3159 aa28.26■■■□□ 2.11
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TM4SF5-201ENST00000270560 NBPF4Q96M43 638 aa28.25■■■□□ 2.11
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TM4SF5-201ENST00000270560 LRRC37A3O60309 1634 aa28.2■■■□□ 2.1
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TM4SF5-201ENST00000270560 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
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TM4SF5-201ENST00000270560 EYA1Q99502 592 aa28.14■■■□□ 2.1
TM4SF5-201ENST00000270560 BCL9O00512 1426 aa28.13■■■□□ 2.09
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TM4SF5-201ENST00000270560 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
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TM4SF5-201ENST00000270560 RGPD1P0DJD0 1748 aa28.03■■■□□ 2.08
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