RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000112552.1

Uhrf2-202, Transcript of E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Uhrf2, Length 1,464 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Akap11E9Q777 1895 aa37.34■■■■□ 3.57
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Kat6bQ8BRB7 1872 aa37.34■■■■□ 3.57
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Rad17Q6NXW6 688 aa37.33■■■■□ 3.57
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Nup153E9Q3G8 1462 aaKnown RBP37.33■■■■□ 3.57
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 FocadA2AKG8 1798 aa37.33■■■■□ 3.57
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Ptpn23Q6PB44 1692 aa37.33■■■■□ 3.57
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Ccne1Q61457 408 aa37.33■■■■□ 3.57
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Cald1E9QA15 768 aaKnown RBP37.32■■■■□ 3.56
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Rgs17Q9QZB0 210 aa37.31■■■■□ 3.56
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Uhrf1bp1lA2RSJ4 1457 aa37.29■■■■□ 3.56
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Plekhd1B2RPU2 505 aa37.26■■■■□ 3.56
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Col15a1O35206 1367 aa37.26■■■■□ 3.56
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Trim28Q62318 834 aa37.26■■■■□ 3.55
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Zpr1Q62384 459 aa37.25■■■■□ 3.55
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Parp14Q2EMV9 1817 aa37.24■■■■□ 3.55
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 TkfcQ8VC30 578 aa37.24■■■■□ 3.55
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Zranb3Q6NZP1 1069 aa37.22■■■■□ 3.55
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Sugp2Q8CH09 1067 aa37.21■■■■□ 3.55
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Col22a1E9Q7P1 1613 aa37.19■■■■□ 3.54
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Eif4a2P10630 407 aa37.19■■■■□ 3.54
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Taok3Q8BYC6 898 aa37.19■■■■□ 3.54
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Tnks1bp1P58871 1720 aa37.18■■■■□ 3.54
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Nwd2Q6P5U7 1742 aa37.17■■■■□ 3.54
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Ppp1r15aP17564 657 aa37.17■■■■□ 3.54
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Gm10471E9Q1C7 252 aa37.15■■■■□ 3.54
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Ppp2r1aQ76MZ3 589 aa37.15■■■■□ 3.54
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Ankrd23Q812A3 306 aa37.15■■■■□ 3.54
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Ly75Q60767 1723 aa37.15■■■■□ 3.54
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 P2rx7Q9Z1M0 595 aa37.14■■■■□ 3.54
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Ubap1lG3UW59 384 aa37.13■■■■□ 3.54
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Kiaa0319Q5SZV5 1081 aa37.13■■■■□ 3.53
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Vps33bP59016 617 aa37.12■■■■□ 3.53
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Rsph6aQ8CDR2 708 aa37.12■■■■□ 3.53
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Kdm6aO70546 1401 aa37.12■■■■□ 3.53
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Eya1P97767 591 aa37.11■■■■□ 3.53
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Rab3gap2Q8BMG7 1366 aa37.1■■■■□ 3.53
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 PnisrA2AJT4 805 aaKnown RBP37.08■■■■□ 3.53
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 4930523C07RikE9Q2T4 99 aa37.08■■■■□ 3.53
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Cc2d1aQ8K1A6 943 aa37.08■■■■□ 3.53
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Ginm1Q91WR6 327 aa37.08■■■■□ 3.53
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Slc12a5Q91V14 1138 aa37.07■■■■□ 3.53
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Mst1rQ62190 1378 aa37.07■■■■□ 3.53
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Sik1Q60670 779 aa37.06■■■■□ 3.52
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Ddb1Q3U1J4 1140 aaKnown RBP37.05■■■■□ 3.52
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Simc1E9Q6E9 1354 aa37.05■■■■□ 3.52
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 MpripP97434 1024 aa37.03■■■■□ 3.52
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Ppp1r37Q8BKR5 712 aa37.03■■■■□ 3.52
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Adgrb1Q3UHD1 1582 aa37.02■■■■□ 3.52
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Ccdc6D3YZP9 469 aa37.01■■■■□ 3.52
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Aplp2Q06335 707 aa37.01■■■■□ 3.51
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Ppp6r1Q7TSI3 856 aa37.01■■■■□ 3.51
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 GakQ99KY4 1305 aa37■■■■□ 3.51
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Nlrp6Q91WS2 869 aa37■■■■□ 3.51
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Fam50bQ9WTJ8 334 aa37■■■■□ 3.51
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Exoc5Q3TPX4 708 aa36.99■■■■□ 3.51
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Kcnh4A2A5F7 1018 aa36.98■■■■□ 3.51
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Ahnak2E9PYB0 1738 aaKnown RBP36.94■■■■□ 3.5
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Adamtsl1Q8BLI0 1745 aa36.92■■■■□ 3.5
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 ThemisQ8BGW0 636 aa36.91■■■■□ 3.5
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 PalmQ9Z0P4 383 aa36.88■■■■□ 3.5
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Elp1Q7TT37 1333 aaKnown RBP36.88■■■■□ 3.49
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Gm21680A0A0G2JGR8 267 aa36.88■■■■□ 3.49
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 4930572O03RikQ8C5Y0 211 aa36.88■■■■□ 3.49
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP36.88■■■■□ 3.49
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Plin1Q8CGN5 517 aa36.87■■■■□ 3.49
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Zcrb1Q9CZ96 217 aaKnown RBP36.87■■■■□ 3.49
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Lrit1Q8K099 624 aa36.86■■■■□ 3.49
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Speer4bQ9D9F7 267 aa36.86■■■■□ 3.49
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Tsen2Q6P7W5 460 aa36.84■■■■□ 3.49
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Q7TT23 1179 aa36.82■■■■□ 3.49
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Arfgef2A2A5R2 1792 aa36.82■■■■□ 3.48
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Ppfibp2O35711 882 aa36.82■■■■□ 3.48
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Mcm10Q0VBD2 885 aa36.82■■■■□ 3.48
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Zfp777B9EKF4 885 aa36.81■■■■□ 3.48
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Bsdc1Q80Y55 427 aa36.8■■■■□ 3.48
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Rpgrip1lQ8CG73 1264 aa36.8■■■■□ 3.48
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 GsdmaQ9EST1 446 aa36.8■■■■□ 3.48
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 TnikP83510 1323 aa36.78■■■■□ 3.48
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Larp1bA0A0A6YXJ7 370 aaKnown RBP36.78■■■■□ 3.48
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 GalcP54818 684 aa36.78■■■■□ 3.48
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Wwc2Q6NXJ0 1187 aa36.75■■■■□ 3.47
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Larp1Q6ZQ58 1072 aaKnown RBP36.75■■■■□ 3.47
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 U2af1Q9D883 239 aaKnown RBP36.75■■■■□ 3.47
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Gsdma3Q5Y4Y6 464 aa36.75■■■■□ 3.47
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Spef2Q8C9J3 1734 aa36.74■■■■□ 3.47
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Pnpla7A2AJ88 1352 aa36.73■■■■□ 3.47
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Kiaa1107Q80TK0 1369 aa36.73■■■■□ 3.47
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Cypt1Q8CH20 168 aa36.73■■■■□ 3.47
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Tns2Q8CGB6 1400 aa36.72■■■■□ 3.47
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 HypkQ9CR41 129 aa36.72■■■■□ 3.47
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Exoc6Q8R313 802 aa36.71■■■■□ 3.47
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Tcerg1Q8CGF7 1100 aaKnown RBP36.67■■■■□ 3.46
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Amotl1Q9D4H4 968 aa36.66■■■■□ 3.46
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Arhgap33Q80YF9 1305 aa36.66■■■■□ 3.46
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Erbb3Q61526 1339 aa36.65■■■■□ 3.46
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Vars2Q3U2A8 1060 aa36.64■■■■□ 3.46
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Afg3l2Q8JZQ2 802 aaKnown RBP36.64■■■■□ 3.46
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Eif3bQ8JZQ9 803 aaKnown RBP36.64■■■■□ 3.46
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Stk31Q99MW1 1018 aa36.63■■■■□ 3.45
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Nsd3Q6P2L6 1439 aa36.63■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 96.4 ms