RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000111980.3

Hoxd4-202, Transcript of Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd4, Length 1,494 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 OptnQ8K3K8 584 aa26.97■■□□□ 1.91
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Slit1Q80TR4 1531 aa26.96■■□□□ 1.91
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Akap11E9Q777 1895 aa26.95■■□□□ 1.9
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 FocadA2AKG8 1798 aa26.95■■□□□ 1.9
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sugp2Q8CH09 1067 aa26.94■■□□□ 1.9
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Uhrf1bp1lA2RSJ4 1457 aa26.93■■□□□ 1.9
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ly75Q60767 1723 aa26.92■■□□□ 1.9
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Pak3Q61036 559 aa26.91■■□□□ 1.9
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ptpn23Q6PB44 1692 aa26.9■■□□□ 1.9
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Taok3Q8BYC6 898 aa26.89■■□□□ 1.9
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Nwd2Q6P5U7 1742 aa26.89■■□□□ 1.89
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Kiaa0319Q5SZV5 1081 aa26.88■■□□□ 1.89
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ccne1Q61457 408 aa26.87■■□□□ 1.89
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Plekhd1B2RPU2 505 aa26.86■■□□□ 1.89
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ubap1lG3UW59 384 aa26.86■■□□□ 1.89
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rad17Q6NXW6 688 aa26.86■■□□□ 1.89
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ccdc6D3YZP9 469 aa26.85■■□□□ 1.89
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Col15a1O35206 1367 aa26.84■■□□□ 1.89
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Zpr1Q62384 459 aa26.84■■□□□ 1.89
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ankrd23Q812A3 306 aa26.82■■□□□ 1.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 TkfcQ8VC30 578 aa26.82■■□□□ 1.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Zranb3Q6NZP1 1069 aa26.81■■□□□ 1.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Vps33bP59016 617 aa26.81■■□□□ 1.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 4930523C07RikE9Q2T4 99 aa26.8■■□□□ 1.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mst1rQ62190 1378 aa26.8■■□□□ 1.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ppp6r1Q7TSI3 856 aa26.79■■□□□ 1.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Adamtsl1Q8BLI0 1745 aa26.78■■□□□ 1.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Parp14Q2EMV9 1817 aa26.78■■□□□ 1.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cald1E9QA15 768 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ginm1Q91WR6 327 aa26.77■■□□□ 1.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm10471E9Q1C7 252 aa26.76■■□□□ 1.87
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa26.76■■□□□ 1.87
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ddb1Q3U1J4 1140 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Trim28Q62318 834 aa26.75■■□□□ 1.87
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 GakQ99KY4 1305 aa26.75■■□□□ 1.87
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Kdm6aO70546 1401 aa26.74■■□□□ 1.87
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sik1Q60670 779 aa26.74■■□□□ 1.87
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Adgrb1Q3UHD1 1582 aa26.73■■□□□ 1.87
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Eif4a2P10630 407 aa26.73■■□□□ 1.87
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cc2d1aQ8K1A6 943 aa26.72■■□□□ 1.87
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Simc1E9Q6E9 1354 aa26.71■■□□□ 1.87
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Kcnh4A2A5F7 1018 aa26.69■■□□□ 1.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ppp1r15aP17564 657 aa26.68■■□□□ 1.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Eya1P97767 591 aa26.68■■□□□ 1.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Exoc5Q3TPX4 708 aa26.68■■□□□ 1.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ppp1r37Q8BKR5 712 aa26.67■■□□□ 1.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rsph6aQ8CDR2 708 aa26.67■■□□□ 1.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ahnak2E9PYB0 1738 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ildr2B5TVM2 661 aa26.66■■□□□ 1.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fam50bQ9WTJ8 334 aa26.66■■□□□ 1.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 PnisrA2AJT4 805 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Lrit1Q8K099 624 aa26.65■■□□□ 1.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Zcrb1Q9CZ96 217 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Wdr66E9Q743 1299 aa26.64■■□□□ 1.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 P2rx7Q9Z1M0 595 aa26.64■■□□□ 1.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Aplp2Q06335 707 aa26.63■■□□□ 1.85
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ppfibp2O35711 882 aa26.61■■□□□ 1.85
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ppp2r1aQ76MZ3 589 aa26.61■■□□□ 1.85
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Elp1Q7TT37 1333 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Arfgef2A2A5R2 1792 aa26.6■■□□□ 1.85
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 MpripP97434 1024 aa26.6■■□□□ 1.85
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Slc12a5Q91V14 1138 aa26.6■■□□□ 1.85
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rab3gap2Q8BMG7 1366 aa26.6■■□□□ 1.85
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm21680A0A0G2JGR8 267 aa26.58■■□□□ 1.85
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 GalcP54818 684 aa26.58■■□□□ 1.85
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Bsdc1Q80Y55 427 aa26.57■■□□□ 1.84
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 ThemisQ8BGW0 636 aa26.57■■□□□ 1.84
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Speer4bQ9D9F7 267 aa26.56■■□□□ 1.84
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Pnpla7A2AJ88 1352 aa26.56■■□□□ 1.84
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 4930572O03RikQ8C5Y0 211 aa26.55■■□□□ 1.84
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Kdm2bQ6P1G2 1309 aa26.53■■□□□ 1.84
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 OscarQ8VBT3 265 aa26.53■■□□□ 1.84
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Apba2P98084 750 aa26.52■■□□□ 1.84
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Vars2Q3U2A8 1060 aa26.5■■□□□ 1.83
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Erbb3Q61526 1339 aa26.5■■□□□ 1.83
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Nsd3Q6P2L6 1439 aa26.5■■□□□ 1.83
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Arhgap33Q80YF9 1305 aa26.49■■□□□ 1.83
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Larp1Q6ZQ58 1072 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Nlrp6Q91WS2 869 aa26.49■■□□□ 1.83
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Plin1Q8CGN5 517 aa26.48■■□□□ 1.83
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tns2Q8CGB6 1400 aa26.47■■□□□ 1.83
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 PalmQ9Z0P4 383 aa26.47■■□□□ 1.83
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Afg3l2Q8JZQ2 802 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Snapc4Q8BP86 1333 aa26.46■■□□□ 1.83
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 VirmaA2AIV2 1811 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Zfp777B9EKF4 885 aa26.45■■□□□ 1.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Larp1bA0A0A6YXJ7 370 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mcm10Q0VBD2 885 aa26.44■■□□□ 1.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 PappaQ8R4K8 1624 aa26.44■■□□□ 1.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Abca3Q8R420 1704 aa26.42■■□□□ 1.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 TnikP83510 1323 aa26.42■■□□□ 1.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gsdma3Q5Y4Y6 464 aa26.42■■□□□ 1.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tsen2Q6P7W5 460 aa26.42■■□□□ 1.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Shank3Q4ACU6 1730 aa26.4■■□□□ 1.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Spef2Q8C9J3 1734 aa26.4■■□□□ 1.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 HypkQ9CR41 129 aa26.4■■□□□ 1.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Eif3bQ8JZQ9 803 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sos2Q02384 1333 aa26.38■■□□□ 1.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 GsdmaQ9EST1 446 aa26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18.6 ms