RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000105256.9

Ctdsp2-202, Transcript of Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctdsp2, Length 4,817 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Ccdc43Q9CR29 222 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
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Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Ppip5k2Q6ZQB6 1129 aa20.44■□□□□ 0.86
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 March6Q6ZQ89 909 aa20.44■□□□□ 0.86
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Stk3Q9JI10 497 aa20.44■□□□□ 0.86
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Me1P06801 572 aa20.43■□□□□ 0.86
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Trim25Q61510 634 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
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Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Naip2Q9QUK4 1447 aa20.43■□□□□ 0.86
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Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Bcl2l13P59017 434 aa20.43■□□□□ 0.86
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Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Tmem132aQ922P8 1018 aa20.41■□□□□ 0.86
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Sv2bQ8BG39 683 aa20.41■□□□□ 0.86
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Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 NmiO35309 314 aa20.4■□□□□ 0.86
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Exoc8Q6PGF7 716 aa20.4■□□□□ 0.86
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Cep57l1Q8VDS7 400 aa20.4■□□□□ 0.86
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Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Pip4k2aO70172 405 aa20.4■□□□□ 0.86
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Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 TxlnbQ8VBT1 685 aa20.39■□□□□ 0.85
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Abcc5Q9R1X5 1436 aa20.39■□□□□ 0.85
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Jakmip3Q5DTN8 844 aa20.39■□□□□ 0.85
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Hoxa7P02830 229 aa20.38■□□□□ 0.85
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Nucb2P81117 420 aa20.38■□□□□ 0.85
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Ppp6r1Q7TSI3 856 aa20.38■□□□□ 0.85
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Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Gsdma3Q5Y4Y6 464 aa20.37■□□□□ 0.85
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 NexmifQ5DTT1 1515 aa20.37■□□□□ 0.85
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Cdk19Q8BWD8 501 aa20.37■□□□□ 0.85
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Nphp1Q9QY53 687 aa20.37■□□□□ 0.85
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 A2mQ6GQT1 1474 aa20.37■□□□□ 0.85
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 PrxO55103 1391 aa20.37■□□□□ 0.85
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Adcy5P84309 1262 aa20.37■□□□□ 0.85
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Luc7lQ9CYI4 371 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
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Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Wdr62Q3U3T8 1523 aa20.37■□□□□ 0.85
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 CrcpO35427 148 aa20.36■□□□□ 0.85
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Secisbp2lQ6A098 1086 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
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Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Terf2O35144 541 aa20.36■□□□□ 0.85
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Slc13a4Q8BZ82 625 aa20.36■□□□□ 0.85
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Bag4Q8CI61 457 aa20.36■□□□□ 0.85
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Pcf11G3X9Z4 1553 aa20.35■□□□□ 0.85
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Sall3Q62255 1320 aa20.35■□□□□ 0.85
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 ClasrpQ8CFC7 668 aa20.35■□□□□ 0.85
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Gtpbp4Q99ME9 634 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Gm10471E9Q1C7 252 aa20.35■□□□□ 0.85
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Serpinb6bO08804 377 aa20.35■□□□□ 0.85
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Gm45140A0A0N4SUM8 220 aa20.34■□□□□ 0.85
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Serpina10Q8R121 448 aa20.34■□□□□ 0.85
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 CarsQ9ER72 831 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 ScaperF8VQ70 1398 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Abcd1P48410 736 aa20.34■□□□□ 0.85
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Tmc1Q8R4P5 757 aa20.34■□□□□ 0.85
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Zkscan7E9PVW1 718 aa20.34■□□□□ 0.85
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Larp1Q6ZQ58 1072 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Tspyl2Q7TQI8 677 aa20.33■□□□□ 0.85
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Mcm3P25206 812 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Tango6Q8C3S2 1079 aa20.33■□□□□ 0.84
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Gnai2P08752 355 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Cpa2Q504N0 417 aa20.33■□□□□ 0.84
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Prpf4bQ61136 1007 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Dhx16G3X8X0 1044 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Rbm28Q8CGC6 750 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Cabp2Q9JLK4 216 aa20.32■□□□□ 0.84
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Gm18336A0A140LIU8 765 aa20.32■□□□□ 0.84
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Hspa4Q61316 841 aa20.31■□□□□ 0.84
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Wwc1Q5SXA9 1104 aa20.31■□□□□ 0.84
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Pip4k2bQ80XI4 416 aa20.31■□□□□ 0.84
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Neo1P97798 1493 aa20.3■□□□□ 0.84
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Ccdc96Q9CR92 584 aa20.3■□□□□ 0.84
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Cfap45Q9D9U9 551 aa20.3■□□□□ 0.84
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Hs1bp3Q3TC93 395 aa20.3■□□□□ 0.84
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Ctr9Q62018 1173 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Magi1Q6RHR9 1471 aa20.3■□□□□ 0.84
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Hdgfl1Q2VPR5 283 aa20.3■□□□□ 0.84
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 HypkQ9CR41 129 aa20.3■□□□□ 0.84
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 SynmQ70IV5 1561 aa20.3■□□□□ 0.84
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Kif2aP28740 705 aa20.29■□□□□ 0.84
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Odf2lQ9D478 642 aa20.29■□□□□ 0.84
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Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Mmel1Q9JLI3 765 aa20.29■□□□□ 0.84
Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 Cep135Q6P5D4 1140 aa20.29■□□□□ 0.84
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