Protein–RNA interactions for Protein: P81117

Nucb2, Nucleobindin-2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb2P81117 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
Nucb2P81117 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
Nucb2P81117 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Nucb2P81117 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Nucb2P81117 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Nucb2P81117 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Nucb2P81117 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Nucb2P81117 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Nucb2P81117 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Nucb2P81117 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Nucb2P81117 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Nucb2P81117 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Nucb2P81117 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Nucb2P81117 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Nucb2P81117 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Nucb2P81117 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Nucb2P81117 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Nucb2P81117 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Nucb2P81117 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Nucb2P81117 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Nucb2P81117 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Nucb2P81117 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Nucb2P81117 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Nucb2P81117 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Nucb2P81117 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Nucb2P81117 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Nucb2P81117 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Nucb2P81117 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Nucb2P81117 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Nucb2P81117 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Nucb2P81117 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Nucb2P81117 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Nucb2P81117 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Nucb2P81117 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Nucb2P81117 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Nucb2P81117 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Nucb2P81117 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Nucb2P81117 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Nucb2P81117 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Nucb2P81117 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Nucb2P81117 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Nucb2P81117 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Nucb2P81117 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Nucb2P81117 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Nucb2P81117 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Nucb2P81117 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Nucb2P81117 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Nucb2P81117 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Nucb2P81117 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Nucb2P81117 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Nucb2P81117 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Nucb2P81117 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Nucb2P81117 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Nucb2P81117 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Nucb2P81117 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Nucb2P81117 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Nucb2P81117 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Nucb2P81117 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Nucb2P81117 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Nucb2P81117 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Nucb2P81117 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Nucb2P81117 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Nucb2P81117 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Nucb2P81117 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Nucb2P81117 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Nucb2P81117 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Nucb2P81117 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Nucb2P81117 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Nucb2P81117 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Nucb2P81117 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Nucb2P81117 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
Nucb2P81117 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Nucb2P81117 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
Nucb2P81117 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Nucb2P81117 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Nucb2P81117 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Nucb2P81117 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Nucb2P81117 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Nucb2P81117 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Nucb2P81117 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Nucb2P81117 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Nucb2P81117 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Nucb2P81117 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Nucb2P81117 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Nucb2P81117 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Nucb2P81117 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Nucb2P81117 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Nucb2P81117 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Nucb2P81117 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Nucb2P81117 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Nucb2P81117 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Nucb2P81117 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Nucb2P81117 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Nucb2P81117 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Nucb2P81117 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Nucb2P81117 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Nucb2P81117 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Nucb2P81117 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Nucb2P81117 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Nucb2P81117 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms