Protein–RNA interactions for Protein: P81117

Nucb2, Nucleobindin-2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb2P81117 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,57■■■■□ 3,76
Nucb2P81117 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37,31■■■■□ 3,56
Nucb2P81117 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,18■■■■□ 3,54
Nucb2P81117 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,96■■■■□ 3,51
Nucb2P81117 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,59■■■■□ 3,45
Nucb2P81117 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36,39■■■■□ 3,42
Nucb2P81117 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,97■■■■□ 3,35
Nucb2P81117 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,96■■■■□ 3,19
Nucb2P81117 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,91■■■■□ 3,18
Nucb2P81117 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,67■■■■□ 3,14
Nucb2P81117 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,55■■■■□ 3,12
Nucb2P81117 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,49■■■■□ 3,11
Nucb2P81117 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,37■■■■□ 3,09
Nucb2P81117 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34,35■■■■□ 3,09
Nucb2P81117 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,27■■■■□ 3,08
Nucb2P81117 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,26■■■■□ 3,07
Nucb2P81117 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
Nucb2P81117 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,01■■■■□ 3,03
Nucb2P81117 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33,96■■■■□ 3,03
Nucb2P81117 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33,88■■■■□ 3,01
Nucb2P81117 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33,52■■■□□ 2,96
Nucb2P81117 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,39■■■□□ 2,94
Nucb2P81117 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,34■■■□□ 2,93
Nucb2P81117 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,2■■■□□ 2,91
Nucb2P81117 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
Nucb2P81117 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
Nucb2P81117 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2,87
Nucb2P81117 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32,95■■■□□ 2,87
Nucb2P81117 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32,92■■■□□ 2,86
Nucb2P81117 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,91■■■□□ 2,86
Nucb2P81117 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32,9■■■□□ 2,86
Nucb2P81117 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,85■■■□□ 2,85
Nucb2P81117 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32,81■■■□□ 2,84
Nucb2P81117 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,62■■■□□ 2,81
Nucb2P81117 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,62■■■□□ 2,81
Nucb2P81117 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,48■■■□□ 2,79
Nucb2P81117 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32,46■■■□□ 2,79
Nucb2P81117 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
Nucb2P81117 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
Nucb2P81117 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32,4■■■□□ 2,78
Nucb2P81117 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,35■■■□□ 2,77
Nucb2P81117 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32,35■■■□□ 2,77
Nucb2P81117 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,33■■■□□ 2,77
Nucb2P81117 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,3■■■□□ 2,76
Nucb2P81117 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32,23■■■□□ 2,75
Nucb2P81117 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,16■■■□□ 2,74
Nucb2P81117 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32,15■■■□□ 2,74
Nucb2P81117 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32,13■■■□□ 2,73
Nucb2P81117 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,12■■■□□ 2,73
Nucb2P81117 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32,01■■■□□ 2,72
Nucb2P81117 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,95■■■□□ 2,7
Nucb2P81117 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,92■■■□□ 2,7
Nucb2P81117 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31,85■■■□□ 2,69
Nucb2P81117 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31,85■■■□□ 2,69
Nucb2P81117 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,81■■■□□ 2,68
Nucb2P81117 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,72■■■□□ 2,67
Nucb2P81117 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,64■■■□□ 2,66
Nucb2P81117 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,6■■■□□ 2,65
Nucb2P81117 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,59■■■□□ 2,65
Nucb2P81117 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC31,59■■■□□ 2,65
Nucb2P81117 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
Nucb2P81117 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Nucb2P81117 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,47■■■□□ 2,63
Nucb2P81117 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,46■■■□□ 2,63
Nucb2P81117 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,45■■■□□ 2,63
Nucb2P81117 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,41■■■□□ 2,62
Nucb2P81117 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
Nucb2P81117 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
Nucb2P81117 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
Nucb2P81117 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,32■■■□□ 2,6
Nucb2P81117 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31,26■■■□□ 2,59
Nucb2P81117 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,25■■■□□ 2,59
Nucb2P81117 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31,25■■■□□ 2,59
Nucb2P81117 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC31,25■■■□□ 2,59
Nucb2P81117 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31,2■■■□□ 2,59
Nucb2P81117 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,18■■■□□ 2,58
Nucb2P81117 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC31,12■■■□□ 2,57
Nucb2P81117 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,07■■■□□ 2,56
Nucb2P81117 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
Nucb2P81117 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Nucb2P81117 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Nucb2P81117 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
Nucb2P81117 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
Nucb2P81117 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,86■■■□□ 2,53
Nucb2P81117 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC30,85■■■□□ 2,53
Nucb2P81117 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,85■■■□□ 2,53
Nucb2P81117 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
Nucb2P81117 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Nucb2P81117 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Nucb2P81117 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Nucb2P81117 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC30,74■■■□□ 2,51
Nucb2P81117 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
Nucb2P81117 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
Nucb2P81117 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,51
Nucb2P81117 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Nucb2P81117 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
Nucb2P81117 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
Nucb2P81117 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Nucb2P81117 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30,52■■■□□ 2,48
Nucb2P81117 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,6 ms