RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000095500.4

Ccdc78-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 78, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Ccdc78, Length 1,651 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Kat6bQ8BRB7 1872 aa14.79□□□□□ -0.04
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 OptnQ8K3K8 584 aa14.78□□□□□ -0.04
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Nup153E9Q3G8 1462 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Trim28Q62318 834 aa14.77□□□□□ -0.04
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Pcgf6Q99NA9 353 aa14.77□□□□□ -0.04
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Akap11E9Q777 1895 aa14.77□□□□□ -0.04
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Ccne1Q61457 408 aa14.77□□□□□ -0.05
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Pm20d1Q8C165 503 aa14.77□□□□□ -0.05
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Uhrf1bp1lA2RSJ4 1457 aa14.77□□□□□ -0.05
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Parp14Q2EMV9 1817 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Col15a1O35206 1367 aa14.74□□□□□ -0.05
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Ppp2r1aQ76MZ3 589 aa14.74□□□□□ -0.05
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 P2rx7Q9Z1M0 595 aa14.74□□□□□ -0.05
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Rab3gap2Q8BMG7 1366 aa14.74□□□□□ -0.05
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Col22a1E9Q7P1 1613 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Eif4a2P10630 407 aa14.72□□□□□ -0.05
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Ppp1r15aP17564 657 aa14.72□□□□□ -0.05
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Tnks1bp1P58871 1720 aa14.72□□□□□ -0.05
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 MpndQ3TV65 487 aa14.71□□□□□ -0.05
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Pak3Q61036 559 aa14.71□□□□□ -0.05
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 TkfcQ8VC30 578 aa14.71□□□□□ -0.05
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Nwd2Q6P5U7 1742 aa14.71□□□□□ -0.05
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Ly75Q60767 1723 aa14.71□□□□□ -0.06
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Plekhd1B2RPU2 505 aa14.71□□□□□ -0.06
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Rsph6aQ8CDR2 708 aa14.71□□□□□ -0.06
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Kdm6aO70546 1401 aa14.7□□□□□ -0.06
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Rgs17Q9QZB0 210 aa14.69□□□□□ -0.06
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Adgrb1Q3UHD1 1582 aa14.69□□□□□ -0.06
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Eya1P97767 591 aa14.68□□□□□ -0.06
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Zranb3Q6NZP1 1069 aa14.68□□□□□ -0.06
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Slc12a5Q91V14 1138 aa14.68□□□□□ -0.06
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Simc1E9Q6E9 1354 aa14.68□□□□□ -0.06
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Mst1rQ62190 1378 aa14.68□□□□□ -0.06
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 PnisrA2AJT4 805 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Zpr1Q62384 459 aa14.68□□□□□ -0.06
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Ankrd23Q812A3 306 aa14.67□□□□□ -0.06
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Gm10471E9Q1C7 252 aa14.66□□□□□ -0.06
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Vps33bP59016 617 aa14.66□□□□□ -0.06
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Ppp1r37Q8BKR5 712 aa14.66□□□□□ -0.06
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Taok3Q8BYC6 898 aa14.65□□□□□ -0.06
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Ginm1Q91WR6 327 aa14.65□□□□□ -0.06
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 4930523C07RikE9Q2T4 99 aa14.64□□□□□ -0.07
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Ahnak2E9PYB0 1738 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Kcnh4A2A5F7 1018 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 MpripP97434 1024 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Cc2d1aQ8K1A6 943 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Sik1Q60670 779 aa14.62□□□□□ -0.07
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Spef2Q8C9J3 1734 aa14.62□□□□□ -0.07
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Arfgef2A2A5R2 1792 aa14.62□□□□□ -0.07
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Ddb1Q3U1J4 1140 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Kiaa0319Q5SZV5 1081 aa14.61□□□□□ -0.07
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Q7TT23 1179 aa14.61□□□□□ -0.07
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Sugp2Q8CH09 1067 aa14.61□□□□□ -0.07
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Nlrp6Q91WS2 869 aa14.61□□□□□ -0.07
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Kiaa1107Q80TK0 1369 aa14.61□□□□□ -0.07
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Rpgrip1lQ8CG73 1264 aa14.61□□□□□ -0.07
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Fam50bQ9WTJ8 334 aa14.61□□□□□ -0.07
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 PalmQ9Z0P4 383 aa14.61□□□□□ -0.07
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 GakQ99KY4 1305 aa14.61□□□□□ -0.07
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 ThemisQ8BGW0 636 aa14.6□□□□□ -0.07
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Wwc2Q6NXJ0 1187 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Ppp6r1Q7TSI3 856 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 GsdmaQ9EST1 446 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Ccdc6D3YZP9 469 aa14.58□□□□□ -0.07
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Aplp2Q06335 707 aa14.58□□□□□ -0.07
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Exoc5Q3TPX4 708 aa14.58□□□□□ -0.07
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Tsen2Q6P7W5 460 aa14.58□□□□□ -0.07
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Exoc6Q8R313 802 aa14.58□□□□□ -0.07
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Zfp777B9EKF4 885 aa14.58□□□□□ -0.08
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Tns2Q8CGB6 1400 aa14.57□□□□□ -0.08
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Adamtsl1Q8BLI0 1745 aa14.57□□□□□ -0.08
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Mcm10Q0VBD2 885 aa14.57□□□□□ -0.08
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Sall2Q9QX96 1004 aa14.57□□□□□ -0.08
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Ubap1lG3UW59 384 aa14.56□□□□□ -0.08
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 4930572O03RikQ8C5Y0 211 aa14.56□□□□□ -0.08
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 TnikP83510 1323 aa14.55□□□□□ -0.08
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Atf7ipQ7TT18 1306 aa14.55□□□□□ -0.08
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Elp1Q7TT37 1333 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Plin1Q8CGN5 517 aa14.55□□□□□ -0.08
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 PappaQ8R4K8 1624 aa14.55□□□□□ -0.08
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Gm21680A0A0G2JGR8 267 aa14.55□□□□□ -0.08
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Lrit1Q8K099 624 aa14.55□□□□□ -0.08
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 U2af1Q9D883 239 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Speer4bQ9D9F7 267 aa14.55□□□□□ -0.08
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Larp1bA0A0A6YXJ7 370 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Zcrb1Q9CZ96 217 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Gsdma3Q5Y4Y6 464 aa14.53□□□□□ -0.08
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Larp1Q6ZQ58 1072 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 HypkQ9CR41 129 aa14.52□□□□□ -0.08
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Trpm3Q5F4S9 1721 aa14.52□□□□□ -0.08
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Pnpla7A2AJ88 1352 aa14.52□□□□□ -0.09
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Ppfibp2O35711 882 aa14.52□□□□□ -0.09
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Bsdc1Q80Y55 427 aa14.51□□□□□ -0.09
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Amotl1Q9D4H4 968 aa14.51□□□□□ -0.09
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Tcerg1Q8CGF7 1100 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Abca3Q8R420 1704 aa14.5□□□□□ -0.09
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 GalcP54818 684 aa14.49□□□□□ -0.09
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Stk31Q99MW1 1018 aa14.49□□□□□ -0.09
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Aox2Q5SGK3 1345 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 25.9 ms