RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000060956.12

Trappc1-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Trappc1, Length 628 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Arap3Q8R5G7 1538 aa8.47□□□□□ -1.05
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Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ankrd36D3Z4K0 1415 aa8.46□□□□□ -1.05
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Itgbl1Q8VDV0 494 aa8.46□□□□□ -1.06
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ybx3Q9JKB3 361 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Kdm2bQ6P1G2 1309 aa8.46□□□□□ -1.06
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Naip7Q9JIB3 1402 aa8.46□□□□□ -1.06
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ddx17Q501J6 650 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fbxo11Q7TPD1 930 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Trim32Q8CH72 655 aa8.45□□□□□ -1.06
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Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gpr37Q9QY42 600 aa8.45□□□□□ -1.06
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Myo3aQ8K3H5 1613 aa8.44□□□□□ -1.06
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pcmtd1P59913 357 aa8.44□□□□□ -1.06
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Smim5Q8BT42 78 aa8.44□□□□□ -1.06
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Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ttc21bQ0HA38 1315 aa8.44□□□□□ -1.06
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Skint5A7XUY5 1461 aa8.44□□□□□ -1.06
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Adgrl2Q8JZZ7 1487 aa8.44□□□□□ -1.06
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Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tns3Q5SSZ5 1440 aa8.43□□□□□ -1.06
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ehbp1l1Q99MS7 1716 aa8.43□□□□□ -1.06
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Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ppp4cP97470 307 aa8.42□□□□□ -1.06
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mtus2Q3UHD3 1353 aa8.42□□□□□ -1.06
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Trappc1-201ENSMUST00000060956 Atf3Q60765 181 aa8.4□□□□□ -1.06
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Caskin2Q8VHK1 1201 aa8.4□□□□□ -1.06
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Zfp142G5E869 1843 aa8.4□□□□□ -1.07
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Robo1O89026 1612 aa8.4□□□□□ -1.07
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tmem94Q7TSH8 1360 aa8.39□□□□□ -1.07
Trappc1-201ENSMUST00000060956 HrcG5E8J6 738 aa8.39□□□□□ -1.07
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rnf40Q3U319 1001 aa8.39□□□□□ -1.07
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rapgefl1Q68EF8 662 aa8.39□□□□□ -1.07
Trappc1-201ENSMUST00000060956 PalldQ9ET54 1408 aa8.38□□□□□ -1.07
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Klra1P20937 262 aa8.38□□□□□ -1.07
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Irf5P56477 497 aa8.38□□□□□ -1.07
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Sulf1Q8K007 870 aa8.38□□□□□ -1.07
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Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa8.37□□□□□ -1.07
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ccdc6D3YZP9 469 aa8.37□□□□□ -1.07
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cyp8b1O88962 500 aa8.37□□□□□ -1.07
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Plekhh2Q8C115 1491 aa8.37□□□□□ -1.07
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Trappc1-201ENSMUST00000060956 Abcc10Q8R4P9 1501 aa8.36□□□□□ -1.07
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Lmtk3Q5XJV6 1424 aa8.36□□□□□ -1.07
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Atp7aQ64430 1491 aa8.35□□□□□ -1.07
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Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fam193bQ3U2K0 892 aa8.35□□□□□ -1.07
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Trappc1-201ENSMUST00000060956 Themis2Q91YX0 663 aa8.35□□□□□ -1.07
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Trappc1-201ENSMUST00000060956 Kif24Q6NWW5 1356 aa8.35□□□□□ -1.07
Trappc1-201ENSMUST00000060956 AnkarA2RT91 1465 aa8.34□□□□□ -1.07
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Col22a1E9Q7P1 1613 aa8.34□□□□□ -1.07
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ankrd34aB2RW11 495 aa8.34□□□□□ -1.07
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Trappc1-201ENSMUST00000060956 PplQ9R269 1755 aa8.34□□□□□ -1.07
Trappc1-201ENSMUST00000060956 KdrP35918 1367 aa8.34□□□□□ -1.07
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Efcab6Q6P1E8 1516 aa8.34□□□□□ -1.08
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Il16O54824 1322 aa8.33□□□□□ -1.08
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Erich6D3Z6S9 713 aa8.33□□□□□ -1.08
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Uggt1Q6P5E4 1551 aa8.33□□□□□ -1.08
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ino80Q6ZPV2 1559 aa8.33□□□□□ -1.08
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Znf423Q80TS5 1292 aa8.33□□□□□ -1.08
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Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slit3Q9WVB4 1523 aa8.33□□□□□ -1.08
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Zfp644E9QA22 1323 aa8.32□□□□□ -1.08
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Sall3Q62255 1320 aa8.32□□□□□ -1.08
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Saxo1B1AXP3 476 aa8.32□□□□□ -1.08
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Map3k9Q3U1V8 1077 aa8.32□□□□□ -1.08
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Emilin2Q8K482 1074 aa8.32□□□□□ -1.08
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Trappc1-201ENSMUST00000060956 Znf330Q922H9 316 aa8.3□□□□□ -1.08
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Trappc1-201ENSMUST00000060956 Psrc1Q9D0P7 329 aa8.3□□□□□ -1.08
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Jph1Q9ET80 660 aa8.3□□□□□ -1.08
Trappc1-201ENSMUST00000060956 VirmaA2AIV2 1811 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Phox2bO35690 314 aa8.29□□□□□ -1.08
Trappc1-201ENSMUST00000060956 MarsQ68FL6 902 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Dph2Q9CR25 489 aa8.29□□□□□ -1.08
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Q9D9H8 365 aa8.29□□□□□ -1.08
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tex14Q7M6U3 1450 aa8.29□□□□□ -1.08
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Col14a1Q80X19 1797 aa8.29□□□□□ -1.08
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Arhgef28P97433 1693 aa8.28□□□□□ -1.08
Trappc1-201ENSMUST00000060956 AU022751B1B0V2 589 aa8.28□□□□□ -1.08
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