Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHK1

Caskin2, Caskin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caskin2Q8VHK1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37,58■■■■□ 3,61
Caskin2Q8VHK1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,11■■■■□ 3,37
Caskin2Q8VHK1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,03■■■■□ 3,2
Caskin2Q8VHK1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,88■■■■□ 3,17
Caskin2Q8VHK1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
Caskin2Q8VHK1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
Caskin2Q8VHK1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33,67■■■□□ 2,98
Caskin2Q8VHK1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33,54■■■□□ 2,96
Caskin2Q8VHK1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,44■■■□□ 2,94
Caskin2Q8VHK1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32,96■■■□□ 2,87
Caskin2Q8VHK1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,94■■■□□ 2,86
Caskin2Q8VHK1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,75■■■□□ 2,83
Caskin2Q8VHK1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32,66■■■□□ 2,82
Caskin2Q8VHK1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,43■■■□□ 2,78
Caskin2Q8VHK1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,33■■■□□ 2,77
Caskin2Q8VHK1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32,29■■■□□ 2,76
Caskin2Q8VHK1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,27■■■□□ 2,76
Caskin2Q8VHK1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,24■■■□□ 2,75
Caskin2Q8VHK1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,19■■■□□ 2,74
Caskin2Q8VHK1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,1■■■□□ 2,73
Caskin2Q8VHK1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,09■■■□□ 2,73
Caskin2Q8VHK1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,91■■■□□ 2,7
Caskin2Q8VHK1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,88■■■□□ 2,69
Caskin2Q8VHK1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,87■■■□□ 2,69
Caskin2Q8VHK1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31,79■■■□□ 2,68
Caskin2Q8VHK1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,76■■■□□ 2,67
Caskin2Q8VHK1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,72■■■□□ 2,67
Caskin2Q8VHK1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,67■■■□□ 2,66
Caskin2Q8VHK1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,61■■■□□ 2,65
Caskin2Q8VHK1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,49■■■□□ 2,63
Caskin2Q8VHK1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31,47■■■□□ 2,63
Caskin2Q8VHK1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31,46■■■□□ 2,63
Caskin2Q8VHK1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Caskin2Q8VHK1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,32■■■□□ 2,6
Caskin2Q8VHK1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,28■■■□□ 2,6
Caskin2Q8VHK1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,23■■■□□ 2,59
Caskin2Q8VHK1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
Caskin2Q8VHK1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,17■■■□□ 2,58
Caskin2Q8VHK1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31,17■■■□□ 2,58
Caskin2Q8VHK1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
Caskin2Q8VHK1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30,91■■■□□ 2,54
Caskin2Q8VHK1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30,9■■■□□ 2,54
Caskin2Q8VHK1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30,79■■■□□ 2,52
Caskin2Q8VHK1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30,77■■■□□ 2,52
Caskin2Q8VHK1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30,77■■■□□ 2,52
Caskin2Q8VHK1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30,74■■■□□ 2,51
Caskin2Q8VHK1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,74■■■□□ 2,51
Caskin2Q8VHK1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
Caskin2Q8VHK1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
Caskin2Q8VHK1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
Caskin2Q8VHK1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Caskin2Q8VHK1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Caskin2Q8VHK1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Caskin2Q8VHK1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Caskin2Q8VHK1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30,02■■■□□ 2,4
Caskin2Q8VHK1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30,01■■■□□ 2,39
Caskin2Q8VHK1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Caskin2Q8VHK1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Caskin2Q8VHK1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29,9■■■□□ 2,38
Caskin2Q8VHK1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Caskin2Q8VHK1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Caskin2Q8VHK1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29,81■■■□□ 2,36
Caskin2Q8VHK1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,8■■■□□ 2,36
Caskin2Q8VHK1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Caskin2Q8VHK1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29,77■■■□□ 2,36
Caskin2Q8VHK1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Caskin2Q8VHK1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,66■■■□□ 2,34
Caskin2Q8VHK1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Caskin2Q8VHK1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Caskin2Q8VHK1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Caskin2Q8VHK1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,59■■■□□ 2,33
Caskin2Q8VHK1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29,58■■■□□ 2,33
Caskin2Q8VHK1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29,54■■■□□ 2,32
Caskin2Q8VHK1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Caskin2Q8VHK1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Caskin2Q8VHK1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Caskin2Q8VHK1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Caskin2Q8VHK1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Caskin2Q8VHK1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Caskin2Q8VHK1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29,44■■■□□ 2,3
Caskin2Q8VHK1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Caskin2Q8VHK1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Caskin2Q8VHK1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Caskin2Q8VHK1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,31■■■□□ 2,28
Caskin2Q8VHK1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29,29■■■□□ 2,28
Caskin2Q8VHK1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Caskin2Q8VHK1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29,2■■■□□ 2,26
Caskin2Q8VHK1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Caskin2Q8VHK1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Caskin2Q8VHK1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Caskin2Q8VHK1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Caskin2Q8VHK1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Caskin2Q8VHK1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Caskin2Q8VHK1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Caskin2Q8VHK1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,07■■■□□ 2,24
Caskin2Q8VHK1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Caskin2Q8VHK1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Caskin2Q8VHK1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Caskin2Q8VHK1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Caskin2Q8VHK1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28,97■■■□□ 2,23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7 ms