RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053252.8

Ctxn1-201, Transcript of Cortexin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctxn1, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 VirmaA2AIV2 1811 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 OscarQ8VBT3 265 aa29.71■■■□□ 2.35
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ppp6r1Q7TSI3 856 aa29.7■■■□□ 2.35
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Map2P20357 1828 aa29.69■■■□□ 2.34
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 RgmbQ7TQ33 436 aa29.69■■■□□ 2.34
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Smg6P61406 1418 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 FancaQ9JL70 1439 aa29.67■■■□□ 2.34
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nol11Q8BJW5 723 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 4930523C07RikE9Q2T4 99 aa29.64■■■□□ 2.34
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 IbtkQ6ZPR6 1352 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Uhrf1bp1lA2RSJ4 1457 aa29.62■■■□□ 2.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pak3Q61036 559 aa29.62■■■□□ 2.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sall2Q9QX96 1004 aa29.61■■■□□ 2.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 CemipQ8BI06 1361 aa29.61■■■□□ 2.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Scaf1Q5U4C3 1256 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tmem132eQ6IEE6 982 aa29.58■■■□□ 2.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ano8Q6PB70 1060 aa29.58■■■□□ 2.33
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 FocadA2AKG8 1798 aa29.57■■■□□ 2.32
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 GakQ99KY4 1305 aa29.57■■■□□ 2.32
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 CrklP47941 303 aa29.56■■■□□ 2.32
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ankrd23Q812A3 306 aa29.56■■■□□ 2.32
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 OptnQ8K3K8 584 aa29.55■■■□□ 2.32
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Hoxb7P09024 217 aa29.54■■■□□ 2.32
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slit1Q80TR4 1531 aa29.54■■■□□ 2.32
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Vps33bP59016 617 aa29.52■■■□□ 2.32
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Apba2P98084 750 aa29.52■■■□□ 2.32
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ddb1Q3U1J4 1140 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zpr1Q62384 459 aa29.49■■■□□ 2.31
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Birc3O08863 600 aa29.48■■■□□ 2.31
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zcrb1Q9CZ96 217 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Plekhd1B2RPU2 505 aa29.47■■■□□ 2.31
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Lrit1Q8K099 624 aa29.47■■■□□ 2.31
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 GalcP54818 684 aa29.46■■■□□ 2.31
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ginm1Q91WR6 327 aa29.46■■■□□ 2.31
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mst1rQ62190 1378 aa29.46■■■□□ 2.31
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cald1E9QA15 768 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ppfibp2O35711 882 aa29.44■■■□□ 2.3
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sik1Q60670 779 aa29.43■■■□□ 2.3
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ppp2r1aQ76MZ3 589 aa29.43■■■□□ 2.3
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Hoxc9P09633 260 aa29.42■■■□□ 2.3
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zranb3Q6NZP1 1069 aa29.42■■■□□ 2.3
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rab3gap2Q8BMG7 1366 aa29.41■■■□□ 2.3
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ezh2Q61188 746 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Exoc5Q3TPX4 708 aa29.39■■■□□ 2.3
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Vars2Q3U2A8 1060 aa29.38■■■□□ 2.29
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rad17Q6NXW6 688 aa29.36■■■□□ 2.29
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 TkfcQ8VC30 578 aa29.35■■■□□ 2.29
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Snapc4Q8BP86 1333 aa29.35■■■□□ 2.29
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Bsdc1Q80Y55 427 aa29.34■■■□□ 2.29
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Erbb3Q61526 1339 aa29.34■■■□□ 2.29
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Col15a1O35206 1367 aa29.34■■■□□ 2.29
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ptpn23Q6PB44 1692 aa29.33■■■□□ 2.29
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ahnak2E9PYB0 1738 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cc2d1aQ8K1A6 943 aa29.32■■■□□ 2.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm10471E9Q1C7 252 aa29.31■■■□□ 2.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Trim28Q62318 834 aa29.31■■■□□ 2.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nlrp6Q91WS2 869 aa29.31■■■□□ 2.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Arfgef2A2A5R2 1792 aa29.31■■■□□ 2.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Kcnh4A2A5F7 1018 aa29.3■■■□□ 2.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ccne1Q61457 408 aa29.3■■■□□ 2.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pnpla7A2AJ88 1352 aa29.29■■■□□ 2.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Wwc2Q6NXJ0 1187 aa29.29■■■□□ 2.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nsd3Q6P2L6 1439 aa29.28■■■□□ 2.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Arhgap33Q80YF9 1305 aa29.28■■■□□ 2.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Parp14Q2EMV9 1817 aa29.27■■■□□ 2.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Adgrb1Q3UHD1 1582 aa29.27■■■□□ 2.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ppp1r15aP17564 657 aa29.27■■■□□ 2.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Exoc6Q8R313 802 aa29.27■■■□□ 2.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Elp1Q7TT37 1333 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pim2Q62070 370 aa29.23■■■□□ 2.27
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fam50bQ9WTJ8 334 aa29.23■■■□□ 2.27
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 PsdQ5DTT2 1024 aa29.22■■■□□ 2.27
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rpgrip1lQ8CG73 1264 aa29.22■■■□□ 2.27
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 P2rx7Q9Z1M0 595 aa29.21■■■□□ 2.27
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Q8BT18 775 aa29.2■■■□□ 2.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Afg3l2Q8JZQ2 802 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 PnisrA2AJT4 805 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Aplp2Q06335 707 aa29.18■■■□□ 2.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Q7TT23 1179 aa29.18■■■□□ 2.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm21680A0A0G2JGR8 267 aa29.17■■■□□ 2.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ccdc85cE9Q6B2 420 aa29.17■■■□□ 2.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ciz1Q8VEH2 845 aa29.17■■■□□ 2.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Abca3Q8R420 1704 aa29.15■■■□□ 2.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slc12a5Q91V14 1138 aa29.15■■■□□ 2.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Kdm6aO70546 1401 aa29.14■■■□□ 2.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Eif4a2P10630 407 aa29.14■■■□□ 2.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rsph6aQ8CDR2 708 aa29.14■■■□□ 2.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Simc1E9Q6E9 1354 aa29.13■■■□□ 2.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zfp777B9EKF4 885 aa29.13■■■□□ 2.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Speer4bQ9D9F7 267 aa29.13■■■□□ 2.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 GsdmaQ9EST1 446 aa29.12■■■□□ 2.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mrs2Q5NCE8 434 aa29.11■■■□□ 2.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Atf7ipQ7TT18 1306 aa29.11■■■□□ 2.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 En2P09066 324 aa29.08■■■□□ 2.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tsen2Q6P7W5 460 aa29.08■■■□□ 2.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ankrd13dQ6PD24 605 aa29.07■■■□□ 2.24
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ppp1r37Q8BKR5 712 aa29.07■■■□□ 2.24
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sos2Q02384 1333 aa29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 21 ms