RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 MMP2P08253 660 aa18.87■□□□□ 0.61
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PTPRK-218ENST00000525459 UPK3BL2E5RIL1 263 aa18.86■□□□□ 0.61
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PTPRK-218ENST00000525459 CADM4Q8NFZ8 388 aa18.84■□□□□ 0.61
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PTPRK-218ENST00000525459 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa18.83■□□□□ 0.61
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PTPRK-218ENST00000525459 PRSS33Q8NF86 280 aa18.83■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 RLN3Q8WXF3 142 aa18.83■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 FOXJ1Q92949 421 aa18.83■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 NSMCE3Q96MG7 304 aa18.83■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 LRRC40Q9H9A6 602 aa18.83■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 CD93Q9NPY3 652 aa18.83■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 PLXNA2O75051 1894 aa18.83■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 AREL1O15033 823 aa18.83■□□□□ 0.6
PTPRK-218ENST00000525459 PMPCBO75439 489 aa18.83■□□□□ 0.6
PTPRK-218ENST00000525459 NDST3O95803 873 aa18.83■□□□□ 0.6
PTPRK-218ENST00000525459 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
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