RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 CHKBQ9Y259 395 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A1W2PQF6 199 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 ESYT3A0FGR9 886 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 FZD6O60353 706 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 ALDH1A2O94788 518 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 PGLSO95336 258 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 CPP00450 1065 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 AGTP01019 485 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 IL1BP01584 269 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 FGF1P05230 155 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 UGT2B4P06133 528 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 CTSLP07711 333 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 MLNP12872 115 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 C5AR1P21730 350 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 XPAP23025 273 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 GKP32189 559 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 SUOXP51687 545 aa9.47□□□□□ -0.89
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SH3BP4-208ENST00000462602 SATB1Q01826 763 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 CDH17Q12864 832 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 TRAF2Q12933 501 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 SPARCL1Q14515 664 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 IHHQ14623 411 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC1A5Q15758 541 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 SYCP2LQ5T4T6 812 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 ANKRD22Q5VYY1 191 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 KIAA1211LQ6NV74 962 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 LRRC8BQ6P9F7 803 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 Q6ZS52 159 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 KDELC2Q7Z4H8 507 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 PDIK1LQ8N165 341 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 SPEM1Q8N4L4 309 aa9.47□□□□□ -0.89
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SH3BP4-208ENST00000462602 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP9.47□□□□□ -0.891e-6■■■■■ 56.2
SH3BP4-208ENST00000462602 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
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SH3BP4-208ENST00000462602 ECHDC3Q96DC8 303 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 KLHL32Q96NJ5 620 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 TRIB3Q96RU7 358 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 HINFPQ9BQA5 517 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 ARNT2Q9HBZ2 717 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 CASS4Q9NQ75 786 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 GRHL1Q9NZI5 618 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 BFARQ9NZS9 450 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 PHTF1Q9UMS5 762 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 SCML1Q9UN30 329 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa9.47□□□□□ -0.89
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SH3BP4-208ENST00000462602 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 TSPAN11A1L157 253 aa9.46□□□□□ -0.9
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SH3BP4-208ENST00000462602 C16orf96A6NNT2 1141 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 ANKRD66B4E2M5 251 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 GOLGA8MH3BSY2 632 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 M0R296 226 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 PPFIA2O75334 1257 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM63AO94886 807 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 PRLP01236 227 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 DNTTP04053 509 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 C7P10643 843 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 ACADMP11310 421 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 COL9A1P20849 921 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 ITGB7P26010 798 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 TNFRSF8P28908 595 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC8A1P32418 973 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 GRIA4P48058 902 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 PSMD8P48556 350 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 NPY2RP49146 381 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 CLCN5P51795 746 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 COPAP53621 1224 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 RPS14P62263 151 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 LAMB3Q13751 1172 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 CST6Q15828 149 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 ARMC3Q5W041 872 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 WDR93Q6P2C0 686 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 FBXL19Q6PCT2 694 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM92Q6UXU6 159 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 MAMSTRQ6ZN01 415 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 USP45Q70EL2 814 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 TMPRSS6Q8IU80 811 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC25A41Q8N5S1 370 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 LPCAT1Q8NF37 534 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 MYRIPQ8NFW9 859 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 OR52K1Q8NGK4 314 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 FBXO25Q8TCJ0 367 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 PIH1D2Q8WWB5 315 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 RAB7BQ96AH8 199 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 SIPA1Q96FS4 1042 aa9.46□□□□□ -0.9
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