RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 NETO2Q8NC67 525 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 TRPV1Q8NER1 839 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 OR10T2Q8NGX3 314 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 OR6Y1Q8NGX8 325 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 C1orf216Q8TAB5 229 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 USP33Q8TEY7 942 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 MFSD3Q96ES6 412 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 FAR2Q96K12 515 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 C8orf48Q96LL4 319 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 RANBP9Q96S59 729 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 AGAP2Q99490 1192 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 EBF4Q9BQW3 602 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 MCMBPQ9BTE3 642 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 DRC3Q9H069 523 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 SIK2Q9H0K1 926 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 VCXQ9H320 206 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 CHRAC1Q9NRG0 131 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 VPS45Q9NRW7 570 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 OXSMQ9NWU1 459 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 CACNG4Q9UBN1 327 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 PLA2G4CQ9UP65 541 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 NEU3Q9UQ49 428 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 SCML2Q9UQR0 700 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 CDYLQ9Y232 598 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 TLR6Q9Y2C9 796 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 ACOT9Q9Y305 439 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 TRPC5OSA6NMA1 111 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 E9PAM4 449 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 G3V2L1 256 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 I6L893 689 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 SYN3O14994 580 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 HDAC3O15379 428 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 ADAMTS4O75173 837 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 KRT36O76013 467 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 MYCP01106 439 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 PRKCGP05129 697 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 NMBRP28336 390 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 MSX1P28360 303 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 TUBP50607 506 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 RENBPP51606 427 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 SESN3P58005 492 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 POU4F1Q01851 419 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 CRHR2Q13324 411 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 TUBB3Q13509 450 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 BLMHQ13867 455 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 SEPT6Q14141 434 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 GRM3Q14832 879 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 HERC3Q15034 1050 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM182AQ5T1J6 154 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 SNX30Q5VWJ9 437 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 CST9Q5W186 159 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 CES4AQ5XG92 561 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 TRIM68Q6AZZ1 485 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 IRGCQ6NXR0 463 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 EPGNQ6UW88 154 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 C16orf89Q6UX73 402 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 GALNT7Q86SF2 657 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 SCN4BQ8IWT1 228 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 NUP93Q8N1F7 819 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 TRIB2Q92519 343 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 DPF3Q92784 378 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF778Q96MU6 729 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 SERPINI1Q99574 410 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 APOL2Q9BQE5 337 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 THTPAQ9BU02 230 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC28BQ9BUN5 200 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 ZYG11BQ9C0D3 744 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 C20orf27Q9GZN8 174 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC25A51Q9H1U9 297 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 SP110Q9HB58 689 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 TCF7L2Q9NQB0 619 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM30AQ9NV96 361 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 PNPOQ9NVS9 261 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 NMRK1Q9NWW6 199 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 COMMD8Q9NX08 183 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 SNX10Q9Y5X0 201 aa9.3□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms