RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568530.5

PDPR-210, Transcript of pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDPR, Length 7,223 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPR-210ENST00000568530 KIAA0895Q8NCT3 520 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 CATSPER1Q8NEC5 780 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 TMEM68Q96MH6 324 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 HEPHQ9BQS7 1158 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 TRIM39Q9HCM9 518 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 GRID1Q9ULK0 1009 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 QSOX1O00391 747 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.055e-14■■■■■ 33.6
PDPR-210ENST00000568530 PDE5AO76074 875 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 SLC35G4P0C7Q5 338 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 SLC1A6P48664 564 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 AP1S2P56377 157 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 MAPK7Q13164 816 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 CRY2Q49AN0 593 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 C2orf27AQ580R0 203 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 RETSATQ6NUM9 610 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 CDH24Q86UP0 819 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 ATP8B4Q8TF62 1192 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 REPS1Q96D71 796 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 OMA1Q96E52 524 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 ZSWIM1Q9BR11 485 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 FUT8Q9BYC5 575 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 LMAN2LQ9H0V9 348 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 VCPKMTQ9H867 229 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 SMCO3A2RU48 225 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 H3BM21 787 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 ATP9AO75110 1047 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 TMEM11P17152 192 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 RPA1P27694 616 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 MYL6P60660 151 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 NFIAQ12857 509 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 BNIP3Q12983 259 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 ZNF846Q147U1 533 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 TSNQ15631 228 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 NLGN4XQ8N0W4 816 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 PTPN18Q99952 460 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 IKZF2Q9UKS7 526 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 ASF1AQ9Y294 204 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 URADA6NGE7 173 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 GCATO75600 419 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 ADH1AP07327 375 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 CXCL8P10145 99 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 PIK3CGP48736 1102 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 PCDH1Q08174 1060 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 SLC15A2Q16348 729 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 FBXO22Q8NEZ5 403 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 MCMBPQ9BTE3 642 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 HIPK3Q9H422 1215 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 TMEM5Q9Y2B1 443 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 SPEF2Q9C093 1822 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 H3BNH8 94 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 TSPAN4O14817 238 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 CYB5AP00167 134 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 SHBGP04278 402 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 CCR1P32246 355 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 VHLP40337 213 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 DMWDQ09019 674 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 SBK1Q52WX2 424 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 AGKQ53H12 422 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 SLC30A6Q6NXT4 461 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 POU5F2Q8N7G0 328 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 GLIS3Q8NEA6 775 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 TBATAQ96M53 351 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 STRA6Q9BX79 667 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 DNAJC28Q9NX36 388 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 XPR1Q9UBH6 696 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 XKRYO14609 159 aa8.5□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 ULK1O75385 1050 aa8.5□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 ADH1CP00326 375 aa8.5□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 RRM1P23921 792 aa8.5□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 GABRR2P28476 465 aa8.5□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 HSD17B2P37059 387 aa8.5□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 SLC6A9P48067 706 aa8.5□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 RCAN1P53805 252 aa8.5□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 TAS2R41P59536 307 aa8.5□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa8.5□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 MARC1Q5VT66 337 aa8.5□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 PCNX4Q63HM2 1172 aa8.5□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 PYHIN1Q6K0P9 492 aa8.5□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 IL27RAQ6UWB1 636 aa8.5□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 DEF8Q6ZN54 512 aa8.5□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 HFE2Q6ZVN8 426 aa8.5□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 SLC22A15Q8IZD6 547 aa8.5□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa8.5□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.5 ms