RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 SNX8Q9Y5X2 465 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 LATS1O95835 1130 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 MMP3P08254 477 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 CTPS1P17812 591 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 RYKP34925 604 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 HDAC4P56524 1084 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 COL10A1Q03692 680 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 SIN3AQ96ST3 1273 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 SPAG4Q9NPE6 437 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 KLHL13Q9P2N7 655 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 PPP6CO00743 305 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 SEC14L5O43304 696 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 MYZAPP0CAP1 466 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 CTSAP10619 480 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 ID2Q02363 134 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 PKP1Q13835 747 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 LURAP1LQ8IV03 231 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP8.03□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 LSMEM1Q8N8F7 131 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 OTULINQ96BN8 352 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC34Q96HJ3 373 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 AGAP2Q99490 1192 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 NUF2Q9BZD4 464 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 PDGFCQ9NRA1 345 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 SLC6A13Q9NSD5 602 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 PASKQ96RG2 1323 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 FRMD3A2A2Y4 597 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 SCAMP1O15126 338 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 PLOD3O60568 738 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 FSHBP01225 129 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 KRT10P13645 584 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 CLDN2P57739 230 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 SNX16P57768 344 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 PROK1P58294 105 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 TMCO3Q6UWJ1 677 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF66Q6ZN08 573 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF793Q6ZN11 406 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 DEF8Q6ZN54 512 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 SLC44A5Q8NCS7 719 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 MCPH1Q8NEM0 835 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 SGCDQ92629 289 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 JAKMIP2Q96AA8 810 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 WDFY2Q96P53 400 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 SIGLEC11Q96RL6 698 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 CDT1Q9H211 546 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1W2PQF6 199 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 SNAP23O00161 211 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 NUDT3O95989 172 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 AKR1B1P15121 316 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 CDH8P55286 799 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 FGFBP1Q14512 234 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 SHBQ15464 509 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 CEP78Q5JTW2 689 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 CHST9Q7L1S5 443 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 GGNQ86UU5 652 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 CAMK1DQ8IU85 385 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 LRRC57Q8N9N7 239 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 CHFRQ96EP1 664 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 PGAM5Q96HS1 289 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 IKZF4Q9H2S9 585 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 AAMDCQ9H7C9 122 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 KIF9Q9HAQ2 790 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 THSD1Q9NS62 852 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 FLRT1Q9NZU1 646 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 SESN1Q9Y6P5 492 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 A8MZ25 164 aa8□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 KLRF2D3W0D1 207 aa8□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 HSPB6O14558 160 aa8□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 NDUFS3O75489 264 aa8□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 MTA2O94776 668 aa8□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 EPHB2P29323 1055 aa8□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 KRT20P35900 424 aa8□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 UBA7P41226 1012 aa8□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
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