RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Clec2iQ9WVF9 217 aa6.67□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Msl3Q9WVG9 525 aa6.67□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Adam17Q9Z0F8 827 aa6.67□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rpl9-ps1S4R1R7 191 aa6.67□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm6370A0A0G2JGX9 315 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 IsxA1A546 240 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmem245B1AZA5 876 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 C7D3YXF5 845 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Adamts14E9PX39 1209 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Herc6F2Z461 1003 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kdelc2G5E897 503 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm6309L7N481 315 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sema6aO35464 1031 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 JchainP01592 159 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 P01670 111 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 P01671 111 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 P01672 111 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PdgfrbP05622 1098 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sbk3P0C5K0 361 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Psmd3P14685 530 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ppp3cbP48453 525 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 SirpaP97797 513 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Wdr36Q3TAQ9 899 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rnf157Q3TEL6 685 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nol9Q3TZX8 714 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fam189a2Q4FZH1 290 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Icam5Q60625 917 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hspa1aQ61696 641 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rexo4Q6PAQ4 432 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 DdnQ80TS7 710 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rnf168Q80XJ2 565 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ttc34Q8C0Q3 554 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sfrp1Q8C4U3 314 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tp53bp2Q8CG79 1128 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Acsf2Q8VCW8 615 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 MydgfQ9CPT4 166 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PclafQ9CQX4 110 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sugt1Q9CX34 336 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Polr3eQ9CZT4 710 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Taf1dQ9D4V4 322 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Syap1Q9D5V6 365 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cyp4v2Q9DBW0 525 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PtprfA2A8L5 1898 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fam43bA2AM80 330 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 XntrpcF8VQM8 1264 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sema3aO08665 772 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 NmbrO54799 390 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 DdcO88533 480 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dlx2P40764 332 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 YwhaqP68254 245 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Adcyap1r1P70205 496 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Adamts1P97857 968 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ebf1Q07802 591 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sec31bQ3TZ89 1158 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ndst1Q3UHN9 882 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Xkr4Q5GH67 647 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 RetsatQ64FW2 609 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gpsm1Q6IR34 673 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 ErfeQ6PGN1 340 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rslcan18Q7M6X5 460 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr212Q7TS33 327 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trit1Q80UN9 467 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rnf38Q8BI21 518 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccdc32Q8BS39 179 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gtse1Q8R080 741 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 NamptQ99KQ4 491 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kif19Q99PT9 997 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 4921530L21RikQ9CQ47 274 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ttc25Q9D4B2 624 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CrotQ9DC50 612 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cacng4Q9JJV4 327 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rgs1Q9JL25 209 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CtsmQ9JL96 333 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ptk2bQ9QVP9 1009 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sept6Q9R1T4 434 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Bmp15Q9Z0L4 392 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Klhdc7bA0A286YD60 1263 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmem233D3Z1U7 110 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm5930D3Z257 264 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn2r74E9PW21 853 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm2832F7AEC7 200 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm3336J3QMQ6 198 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 MrasO08989 208 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dmp1O55188 503 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Il6raP22272 460 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gria2P23819 883 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Eci1P42125 289 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Btg3P50615 252 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Col28a1Q2UY11 1141 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Parp3Q3ULW8 533 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Foxred2Q3USW5 665 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mpzl3Q3V3F6 237 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rnf145Q5SWK7 663 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cln3Q61124 438 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 MogQ61885 246 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fndc3bQ6NWW9 1207 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Smpd4Q6ZPR5 823 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tspan18Q80WR1 248 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 GnsQ8BFR4 544 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Grik4Q8BMF5 956 aa6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 22.1 ms