Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
Sema3aO08665 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Sema3aO08665 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Sema3aO08665 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Sema3aO08665 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Sema3aO08665 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Sema3aO08665 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Sema3aO08665 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Sema3aO08665 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Sema3aO08665 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Sema3aO08665 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Sema3aO08665 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
Sema3aO08665 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
Sema3aO08665 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Sema3aO08665 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Sema3aO08665 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Sema3aO08665 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
Sema3aO08665 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Sema3aO08665 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Sema3aO08665 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Sema3aO08665 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Sema3aO08665 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Sema3aO08665 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Sema3aO08665 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Sema3aO08665 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Sema3aO08665 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Sema3aO08665 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Sema3aO08665 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Sema3aO08665 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Sema3aO08665 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Sema3aO08665 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Sema3aO08665 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Sema3aO08665 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Sema3aO08665 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Sema3aO08665 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Sema3aO08665 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Sema3aO08665 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Sema3aO08665 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Sema3aO08665 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Sema3aO08665 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Sema3aO08665 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Sema3aO08665 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Sema3aO08665 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Sema3aO08665 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Sema3aO08665 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sema3aO08665 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sema3aO08665 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sema3aO08665 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sema3aO08665 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Sema3aO08665 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Sema3aO08665 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Sema3aO08665 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Sema3aO08665 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Sema3aO08665 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Sema3aO08665 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Sema3aO08665 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sema3aO08665 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Sema3aO08665 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Sema3aO08665 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sema3aO08665 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Sema3aO08665 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Sema3aO08665 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sema3aO08665 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Sema3aO08665 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sema3aO08665 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sema3aO08665 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sema3aO08665 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sema3aO08665 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Sema3aO08665 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sema3aO08665 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sema3aO08665 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sema3aO08665 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sema3aO08665 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Sema3aO08665 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sema3aO08665 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sema3aO08665 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Sema3aO08665 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sema3aO08665 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Sema3aO08665 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Sema3aO08665 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sema3aO08665 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sema3aO08665 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sema3aO08665 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sema3aO08665 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sema3aO08665 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sema3aO08665 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sema3aO08665 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sema3aO08665 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Sema3aO08665 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sema3aO08665 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sema3aO08665 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sema3aO08665 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sema3aO08665 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sema3aO08665 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sema3aO08665 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sema3aO08665 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sema3aO08665 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sema3aO08665 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sema3aO08665 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sema3aO08665 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms