Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX34

Sugt1, Protein SGT1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sugt1Q9CX34 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
Sugt1Q9CX34 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Sugt1Q9CX34 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Sugt1Q9CX34 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Sugt1Q9CX34 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
Sugt1Q9CX34 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
Sugt1Q9CX34 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Sugt1Q9CX34 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Sugt1Q9CX34 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Sugt1Q9CX34 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Sugt1Q9CX34 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Sugt1Q9CX34 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Sugt1Q9CX34 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Sugt1Q9CX34 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Sugt1Q9CX34 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Sugt1Q9CX34 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Sugt1Q9CX34 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Sugt1Q9CX34 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Sugt1Q9CX34 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Sugt1Q9CX34 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Sugt1Q9CX34 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sugt1Q9CX34 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Sugt1Q9CX34 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sugt1Q9CX34 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Sugt1Q9CX34 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Sugt1Q9CX34 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Sugt1Q9CX34 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Sugt1Q9CX34 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Sugt1Q9CX34 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sugt1Q9CX34 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sugt1Q9CX34 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sugt1Q9CX34 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sugt1Q9CX34 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sugt1Q9CX34 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sugt1Q9CX34 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Sugt1Q9CX34 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Sugt1Q9CX34 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sugt1Q9CX34 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sugt1Q9CX34 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sugt1Q9CX34 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sugt1Q9CX34 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sugt1Q9CX34 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sugt1Q9CX34 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Sugt1Q9CX34 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sugt1Q9CX34 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sugt1Q9CX34 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Sugt1Q9CX34 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sugt1Q9CX34 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sugt1Q9CX34 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sugt1Q9CX34 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sugt1Q9CX34 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sugt1Q9CX34 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sugt1Q9CX34 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sugt1Q9CX34 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sugt1Q9CX34 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sugt1Q9CX34 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sugt1Q9CX34 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sugt1Q9CX34 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sugt1Q9CX34 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sugt1Q9CX34 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sugt1Q9CX34 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Sugt1Q9CX34 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Sugt1Q9CX34 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sugt1Q9CX34 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sugt1Q9CX34 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sugt1Q9CX34 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sugt1Q9CX34 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sugt1Q9CX34 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sugt1Q9CX34 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sugt1Q9CX34 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sugt1Q9CX34 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sugt1Q9CX34 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sugt1Q9CX34 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Sugt1Q9CX34 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Sugt1Q9CX34 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sugt1Q9CX34 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sugt1Q9CX34 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sugt1Q9CX34 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sugt1Q9CX34 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sugt1Q9CX34 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Sugt1Q9CX34 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sugt1Q9CX34 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sugt1Q9CX34 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sugt1Q9CX34 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sugt1Q9CX34 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Sugt1Q9CX34 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sugt1Q9CX34 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sugt1Q9CX34 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sugt1Q9CX34 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sugt1Q9CX34 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sugt1Q9CX34 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sugt1Q9CX34 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sugt1Q9CX34 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sugt1Q9CX34 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sugt1Q9CX34 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sugt1Q9CX34 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sugt1Q9CX34 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sugt1Q9CX34 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sugt1Q9CX34 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Sugt1Q9CX34 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms