Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC50

Crot, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrotQ9DC50 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
CrotQ9DC50 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CrotQ9DC50 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CrotQ9DC50 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CrotQ9DC50 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
CrotQ9DC50 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CrotQ9DC50 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CrotQ9DC50 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
CrotQ9DC50 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
CrotQ9DC50 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CrotQ9DC50 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CrotQ9DC50 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CrotQ9DC50 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
CrotQ9DC50 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
CrotQ9DC50 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CrotQ9DC50 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CrotQ9DC50 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CrotQ9DC50 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CrotQ9DC50 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CrotQ9DC50 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CrotQ9DC50 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
CrotQ9DC50 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CrotQ9DC50 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CrotQ9DC50 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CrotQ9DC50 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CrotQ9DC50 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
CrotQ9DC50 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CrotQ9DC50 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CrotQ9DC50 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CrotQ9DC50 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CrotQ9DC50 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CrotQ9DC50 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CrotQ9DC50 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CrotQ9DC50 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CrotQ9DC50 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CrotQ9DC50 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CrotQ9DC50 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CrotQ9DC50 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CrotQ9DC50 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CrotQ9DC50 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CrotQ9DC50 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CrotQ9DC50 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CrotQ9DC50 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CrotQ9DC50 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CrotQ9DC50 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CrotQ9DC50 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CrotQ9DC50 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CrotQ9DC50 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CrotQ9DC50 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CrotQ9DC50 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CrotQ9DC50 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CrotQ9DC50 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CrotQ9DC50 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CrotQ9DC50 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CrotQ9DC50 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CrotQ9DC50 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CrotQ9DC50 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CrotQ9DC50 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CrotQ9DC50 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CrotQ9DC50 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CrotQ9DC50 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CrotQ9DC50 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CrotQ9DC50 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CrotQ9DC50 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CrotQ9DC50 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CrotQ9DC50 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CrotQ9DC50 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CrotQ9DC50 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CrotQ9DC50 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CrotQ9DC50 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CrotQ9DC50 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CrotQ9DC50 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CrotQ9DC50 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CrotQ9DC50 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CrotQ9DC50 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CrotQ9DC50 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CrotQ9DC50 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CrotQ9DC50 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CrotQ9DC50 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CrotQ9DC50 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CrotQ9DC50 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CrotQ9DC50 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CrotQ9DC50 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CrotQ9DC50 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CrotQ9DC50 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CrotQ9DC50 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CrotQ9DC50 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CrotQ9DC50 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CrotQ9DC50 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CrotQ9DC50 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CrotQ9DC50 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CrotQ9DC50 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CrotQ9DC50 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CrotQ9DC50 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CrotQ9DC50 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CrotQ9DC50 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CrotQ9DC50 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CrotQ9DC50 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CrotQ9DC50 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CrotQ9DC50 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms