Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC43.63■■■■■ 4.57
Parp3Q3ULW8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
Parp3Q3ULW8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
Parp3Q3ULW8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
Parp3Q3ULW8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
Parp3Q3ULW8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Parp3Q3ULW8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Parp3Q3ULW8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Parp3Q3ULW8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
Parp3Q3ULW8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
Parp3Q3ULW8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Parp3Q3ULW8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
Parp3Q3ULW8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Parp3Q3ULW8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Parp3Q3ULW8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Parp3Q3ULW8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Parp3Q3ULW8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Parp3Q3ULW8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Parp3Q3ULW8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Parp3Q3ULW8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Parp3Q3ULW8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Parp3Q3ULW8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Parp3Q3ULW8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
Parp3Q3ULW8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Parp3Q3ULW8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Parp3Q3ULW8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Parp3Q3ULW8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Parp3Q3ULW8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Parp3Q3ULW8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Parp3Q3ULW8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Parp3Q3ULW8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Parp3Q3ULW8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Parp3Q3ULW8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Parp3Q3ULW8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
Parp3Q3ULW8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Parp3Q3ULW8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Parp3Q3ULW8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Parp3Q3ULW8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Parp3Q3ULW8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Parp3Q3ULW8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Parp3Q3ULW8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.07■■■□□ 2.89
Parp3Q3ULW8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
Parp3Q3ULW8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Parp3Q3ULW8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Parp3Q3ULW8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
Parp3Q3ULW8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Parp3Q3ULW8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Parp3Q3ULW8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Parp3Q3ULW8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Parp3Q3ULW8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Parp3Q3ULW8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Parp3Q3ULW8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Parp3Q3ULW8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Parp3Q3ULW8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Parp3Q3ULW8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Parp3Q3ULW8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Parp3Q3ULW8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Parp3Q3ULW8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Parp3Q3ULW8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Parp3Q3ULW8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Parp3Q3ULW8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Parp3Q3ULW8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Parp3Q3ULW8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Parp3Q3ULW8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Parp3Q3ULW8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Parp3Q3ULW8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Parp3Q3ULW8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Parp3Q3ULW8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Parp3Q3ULW8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Parp3Q3ULW8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Parp3Q3ULW8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Parp3Q3ULW8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Parp3Q3ULW8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Parp3Q3ULW8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Parp3Q3ULW8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Parp3Q3ULW8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Parp3Q3ULW8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
Parp3Q3ULW8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Parp3Q3ULW8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
Parp3Q3ULW8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Parp3Q3ULW8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Parp3Q3ULW8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Parp3Q3ULW8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
Parp3Q3ULW8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Parp3Q3ULW8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Parp3Q3ULW8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
Parp3Q3ULW8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Parp3Q3ULW8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Parp3Q3ULW8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Parp3Q3ULW8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Parp3Q3ULW8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Parp3Q3ULW8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Parp3Q3ULW8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Parp3Q3ULW8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Parp3Q3ULW8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Parp3Q3ULW8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Parp3Q3ULW8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Parp3Q3ULW8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Parp3Q3ULW8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Parp3Q3ULW8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms