RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582782.5

RPL17-215, Transcript of ribosomal protein L17, human

TSL 3

Gene RPL17, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL17-215	ENST00000582782	GNAQ	P50148	359 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL17-215	ENST00000582782	BLK	P51451	505 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL17-215	ENST00000582782	CDH8	P55286	799 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL17-215	ENST00000582782	RHAG	Q02094	409 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL17-215	ENST00000582782	TFF2	Q03403	129 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL17-215	ENST00000582782	ZBTB16	Q05516	673 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL17-215	ENST00000582782	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPL17-215	ENST00000582782	FOXF2	Q12947	444 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL17-215	ENST00000582782	CDC16	Q13042	620 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL17-215	ENST00000582782	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPL17-215	ENST00000582782	VEPH1	Q14D04	833 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL17-215	ENST00000582782	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL17-215	ENST00000582782	PROSER3	Q2NL68	480 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL17-215	ENST00000582782	C5orf22	Q49AR2	442 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL17-215	ENST00000582782	CCDC184	Q52MB2	194 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL17-215	ENST00000582782	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL17-215	ENST00000582782	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL17-215	ENST00000582782	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL17-215	ENST00000582782	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
RPL17-215	ENST00000582782	NEK9	Q8TD19	979 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL17-215	ENST00000582782	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL17-215	ENST00000582782	DPF1	Q92782	380 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL17-215	ENST00000582782	GTF3C6	Q969F1	213 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL17-215	ENST00000582782	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPL17-215	ENST00000582782	MAP7D2	Q96T17	732 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL17-215	ENST00000582782	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL17-215	ENST00000582782	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL17-215	ENST00000582782	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL17-215	ENST00000582782	PDE7B	Q9NP56	450 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL17-215	ENST00000582782	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL17-215	ENST00000582782	HAO1	Q9UJM8	370 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL17-215	ENST00000582782	MAFF	Q9ULX9	164 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL17-215	ENST00000582782	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL17-215	ENST00000582782	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL17-215	ENST00000582782	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL17-215	ENST00000582782	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	KCNJ18	B7U540	433 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	PAGE4	O60829	102 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	SLC2A4	P14672	509 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	CSTF3	Q12996	717 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	MTA1	Q13330	715 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	PLCB4	Q15147	1175 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	PPP2R5B	Q15173	497 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	AWAT1	Q58HT5	328 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	RAB41	Q5JT25	222 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	TSSK4	Q6SA08	328 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	TEX11	Q8IYF3	940 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	FAM47B	Q8NA70	645 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	KCTD6	Q8NC69	237 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	KAT2B	Q92831	832 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	STRA6	Q9BX79	667 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	SIL1	Q9H173	461 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	FBXO40	Q9UH90	709 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	MTMR6	Q9Y217	621 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	BTBD18	B2RXH4	712 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782		H7C0S8	307 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782		H7C1Q1	480 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	USP12	O75317	370 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	NFATC1	O95644	943 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	RB1	P06400	928 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	CDK4	P11802	303 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	KRT10	P13645	584 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	CHRNA5	P30532	468 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	UBA7	P41226	1012 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	ARSF	P54793	590 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	TUBA4A	P68366	448 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	GALNT3	Q14435	633 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	IRF3	Q14653	427 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	RPE65	Q16518	533 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	PLK5	Q496M5	336 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPL17-215	ENST00000582782	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63

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