RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	PIP5K1C	O60331	668 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	TLR2	O60603	784 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	GLP2R	O95838	553 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	SLC25A27	O95847	323 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	PGK2	P07205	417 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	ITGA5	P08648	1049 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	ADRA1D	P25100	572 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	AKT1	P31749	480 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	MAP2K2	P36507	400 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	GSTM5	P46439	218 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	C1QTNF8	P60827	252 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	UBXN2A	P68543	259 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	GHRHR	Q02643	423 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	SREBF2	Q12772	1141 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	IL17A	Q16552	155 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	TTC30A	Q86WT1	665 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	TERB1	Q8NA31	727 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	BICD2	Q8TD16	824 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	CCT6B	Q92526	530 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	UROC1	Q96N76	676 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	TIMP4	Q99727	224 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	CIPC	Q9C0C6	399 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	MAGEH1	Q9H213	219 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	ACAD9	Q9H845	621 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	RNF186	Q9NXI6	227 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	VPS4A	Q9UN37	437 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	PTPRF	P10586	1907 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	FAM86B1	E9PN63	330 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	SYT5	O00445	386 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	DHH	O43323	396 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	FIBP	O43427	364 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	TMPRSS11D	O60235	418 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	TDP2	O95551	362 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	CER1	O95813	267 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	CYP3A4	P08684	503 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	ALAD	P13716	330 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	CYP3A7	P24462	503 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	CCNA1	P78396	465 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	CNTN2	Q02246	1040 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	SEMA3B	Q13214	749 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	KCNJ12	Q14500	433 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	SLC39A14	Q15043	492 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	TIGD6	Q17RP2	521 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	LETM2	Q2VYF4	491 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	WDR78	Q5VTH9	848 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	ATL3	Q6DD88	541 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	NEK8	Q86SG6	692 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	REPS1	Q96D71	796 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	MMS19	Q96T76	1030 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	MROH8	Q9H579	483 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	SNX15	Q9NRS6	342 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	VPS45	Q9NRW7	570 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	FBXO40	Q9UH90	709 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	GJD2	Q9UKL4	321 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	CFAP45	Q9UL16	551 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	INSL6	Q9Y581	213 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	ASTN1	O14525	1302 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934		M0QZQ0	153 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	SPTLC2	O15270	562 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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