RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536265.5

DDX11-208, Transcript of DEAD/H-box helicase 11, human

TSL 5

Gene DDX11, Length 3,603 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX11-208	ENST00000536265	CDK18	Q07002	472 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	TWF1	Q12792	350 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	LAMB3	Q13751	1172 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	CSHL1	Q14406	222 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	GALNT3	Q14435	633 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	GEN1	Q17RS7	908 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	PLD6	Q8N2A8	252 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	SPG21	Q9NZD8	308 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	WASH4P	A8MWX3	477 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	DNAJC6	O75061	913 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	PROC	P04070	461 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	RAB10	P61026	200 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	CDH18	Q13634	790 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	FAM83E	Q2M2I3	478 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	ZC3HC1	Q86WB0	502 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	STMN2	Q93045	179 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	11.64	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	VPS28	Q9UK41	221 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	YIPF1	Q9Y548	306 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	CEP350	Q5VT06	3117 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265		B2RBV5	119 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	CLDN11	O75508	207 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	PTPN4	P29074	926 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	CRABP2	P29373	138 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	PGGT1B	P53609	377 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	CBLB	Q13191	982 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	SERINC3	Q13530	473 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	GCNA	Q96QF7	691 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	GPAM	Q9HCL2	828 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	CD248	Q9HCU0	757 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265		A0A0D9SEW6	157 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	NEMP1	O14524	444 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	COCH	O43405	550 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	CIB2	O75838	187 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	ATP6V1G2	O95670	118 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	GLP2R	O95838	553 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	CALB2	P22676	271 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	SLC1A2	P43004	574 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	ZNF460	Q14592	562 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	RANBP10	Q6VN20	620 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	TTC7B	Q86TV6	843 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	FAM136A	Q96C01	138 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	MAGEH1	Q9H213	219 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	PNPO	Q9NVS9	261 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	ITM2A	O43736	263 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	BNIP3L	O60238	219 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	LRG1	P02750	347 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	HDC	P19113	662 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	NAGLU	P54802	743 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	CDH4	P55283	916 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	OCRL	Q01968	901 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	GPNMB	Q14956	572 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	DBN1	Q16643	649 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	LDB1	Q86U70	411 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	INPP5D	Q92835	1189 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	ACSS2	Q9NR19	701 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	TK2	O00142	265 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	PFDN6	O15212	129 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	SOD2	P04179	222 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	PCLAF	Q15004	111 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	TPGS2	Q68CL5	300 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	ITIH5	Q86UX2	942 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	ELMOD1	Q8N336	334 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	GPR22	Q99680	433 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-208	ENST00000536265	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		11.62	□□□□□ -0.55

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