RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	UGT2B4	P06133	528 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	RGR	P47804	291 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	RXRG	P48443	463 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	HCAR3	P49019	387 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	ACAP1	Q15027	740 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	TSC1	Q92574	1164 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	GATA6	Q92908	595 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	EXOC2	Q96KP1	924 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	BMF	Q96LC9	184 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	12.89	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	DNAJC7	Q99615	494 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	MYOC	Q99972	504 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	NUP85	Q9BW27	656 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	TSPY26P	Q9H489	355 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	GDF3	Q9NR23	364 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	GPR27	Q9NS67	375 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	12.89	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	PTPRB	P23467	1997 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	CACNA1B	Q00975	2339 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	DFNA5	O60443	496 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	PCDH8	O95206	1070 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	RARA	P10276	462 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	TIMP2	P16035	220 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	DES	P17661	470 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	ITIH2	P19823	946 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	IL4R	P24394	825 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	GRK6	P43250	576 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	CLDN2	P57739	230 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	OVGP1	Q12889	678 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	BNIP3	Q12983	259 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRRC73	Q5JTD7	316 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	VSTM4	Q8IW00	320 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC22A18AS	Q8N1D0	253 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	RYBP	Q8N488	228 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	RNF214	Q8ND24	703 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR13H1	Q8NG92	308 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	SKA1	Q96BD8	255 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	UBA2	Q9UBT2	640 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	12.88	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRRK1	Q38SD2	2015 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	TSPAN11	A1L157	253 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	POM121B	A6NF01	834 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	IGLON5	A6NGN9	336 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	MUSK	O15146	869 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	PIGN	O95427	931 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	IGSF6	O95976	241 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	PEX11B	O96011	259 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	C1QTNF9	P0C862	333 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	AMPD1	P23109	780 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARSE	P51690	589 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	RHOA	P61586	193 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	RPS21	P63220	83 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	STAT4	Q14765	748 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	VPS36	Q86VN1	386 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM71B	Q8TC56	605 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	RAB7B	Q96AH8	199 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	CHP1	Q99653	195 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	CDC6	Q99741	560 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		12.87	□□□□□ -0.35

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