RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 EOGTQ5NDL2 527 aa29.96■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 C9orf64Q5T6V5 341 aa29.96■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa29.96■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 OR6K2Q8NGY2 324 aa29.96■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa29.96■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa29.96■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 CD68P34810 354 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 RPS9P46781 194 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 SCNN1BP51168 640 aa29.96■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 P3H1Q32P28 736 aa29.96■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 PLPP6Q8IY26 295 aa29.96■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 PRSS16Q9NQE7 514 aa29.96■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 WHRNQ9P202 907 aa29.96■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 NFU1Q9UMS0 254 aa29.96■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 OPHN1O60890 802 aa29.95■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 CR2P20023 1033 aa29.95■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 ECHS1P30084 290 aa29.95■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 TRADDQ15628 312 aa29.95■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 SEMA3CQ99985 751 aa29.95■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 DPH5Q9H2P9 285 aa29.95■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 CHRDQ9H2X0 955 aa29.95■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 GLOD4Q9HC38 313 aa29.95■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 PCDH9Q9HC56 1237 aa29.95■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 PI15O43692 258 aa29.94■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 KRT14P02533 472 aa29.94■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa29.94■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 NFKB1P19838 968 aa29.94■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 RPL21P46778 160 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 DSC2Q02487 901 aa29.94■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 STARD3Q14849 445 aa29.94■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 ALG1LQ6GMV1 187 aa29.94■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 KIAA1211LQ6NV74 962 aa29.94■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa29.94■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 CHST14Q8NCH0 376 aa29.94■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 CAVIN3Q969G5 261 aa29.94■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 NUDCD1Q96RS6 583 aa29.94■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 TRIM31Q9BZY9 425 aa29.94■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 ASIC3Q9UHC3 531 aa29.94■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 A0A1W2PQF6 199 aa29.93■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 ATG13O75143 517 aa29.93■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 COL9A1P20849 921 aa29.93■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 IVDP26440 423 aa29.93■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 ACTN2P35609 894 aa29.93■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 CSNK1DP48730 415 aa29.93■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP29.93■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 MYLK3Q32MK0 819 aa29.93■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa29.93■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 SRLQ86TD4 932 aa29.93■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 STK40Q8N2I9 435 aa29.93■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 BBOF1Q8ND07 529 aa29.93■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 SCUBE2Q9NQ36 999 aa29.93■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 GRHL1Q9NZI5 618 aa29.93■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 RSPH14Q9UHP6 348 aa29.93■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 SNX24Q9Y343 169 aa29.93■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 ANKRD36A6QL64 1941 aa29.93■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 F5H423 210 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 NDC80O14777 642 aa29.93■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 INSIG1O15503 277 aa29.93■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 ATP8B1O43520 1251 aa29.93■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 AOC1P19801 751 aa29.93■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 ITIH2P19823 946 aa29.93■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 GKP32189 559 aa29.93■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 NIPAL4Q0D2K0 466 aa29.93■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM92Q6UXU6 159 aa29.93■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 ARRDC2Q8TBH0 407 aa29.93■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 SNF8Q96H20 258 aa29.93■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 SLC25A51Q9H1U9 297 aa29.93■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 GBA3Q9H227 469 aa29.93■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 NOD2Q9HC29 1040 aa29.93■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 TNFRSF10AO00220 468 aa29.92■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 CRY1Q16526 586 aa29.92■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 SYT13Q7L8C5 426 aa29.92■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 NSMCE3Q96MG7 304 aa29.92■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa29.92■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa29.92■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 C2orf42Q9NWW7 574 aa29.92■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 POP4O95707 220 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 RPL22P35268 128 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 CAV1Q03135 178 aa29.91■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 OR8D1Q8WZ84 308 aa29.91■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 HEPHQ9BQS7 1158 aa29.91■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 EPHX3Q9H6B9 360 aa29.91■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 CD248Q9HCU0 757 aa29.91■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa29.91■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 METTL18O95568 372 aa29.9■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 CES1P23141 567 aa29.9■■■□□ 2.38
ECHS1-201ENST00000368547 PSMB4P28070 264 aa29.9■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74 ms