RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP0.98□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC52A1Q9NWF4 448 aa0.98□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa0.98□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FNIP2Q9P278 1114 aa0.98□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UPB1Q9UBR1 384 aa0.98□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC9A2Q9UBY0 812 aa0.98□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A0A0G2JPF8 293 aa0.97□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP0.97□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C17orf102A2RUQ5 167 aa0.97□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM90A18PA6NE21 464 aa0.97□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM90A16PA6NEW6 464 aa0.97□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa0.97□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa0.97□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa0.97□□□□□ -2.25
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IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CHL1O00533 1208 aa0.97□□□□□ -2.25
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IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM90A15PP0C7V4 464 aa0.97□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM90A14PP0C7W9 464 aa0.97□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DNAH10OSP0CZ25 163 aa0.97□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa0.97□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HARSP12081 509 aaKnown RBP0.97□□□□□ -2.25
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IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SP100P23497 879 aaPredicted RBP0.97□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AVPR2P30518 371 aa0.97□□□□□ -2.25
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IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RPL3P39023 403 aaKnown RBP0.97□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PEX5P50542 639 aa0.97□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LUMP51884 338 aaPredicted RBP0.97□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TUBB4BP68371 445 aa0.97□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP0.97□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RELQ04864 619 aaPredicted RBP0.97□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM27E3Q08E93 113 aa0.97□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PMS2P11Q13670 270 aa0.97□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EFNB3Q15768 340 aa0.97□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC35G1Q2M3R5 365 aa0.97□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ACCSLQ4AC99 568 aa0.97□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa0.97□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 STXBP5Q5T5C0 1151 aa0.97□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LCTLQ6UWM7 567 aa0.97□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GFRALQ6UXV0 394 aa0.97□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SCN4BQ8IWT1 228 aa0.97□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ODF3L1Q8IXM7 274 aa0.97□□□□□ -2.25
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IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FBXL16Q8N461 479 aa0.97□□□□□ -2.25
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IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR4N2Q8NGD1 307 aa0.97□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BBS10Q8TAM1 723 aa0.97□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ARRDC2Q8TBH0 407 aa0.97□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP0.97□□□□□ -2.25
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IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCDC134Q9H6E4 229 aa0.97□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ACAD9Q9H845 621 aa0.97□□□□□ -2.25
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IGHVII-40-1-201ENST00000517316 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP0.97□□□□□ -2.25
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IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC7A10Q9NS82 523 aa0.97□□□□□ -2.25
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IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C1RLQ9NZP8 487 aa0.97□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP0.97□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CHPF2Q9P2E5 772 aa0.97□□□□□ -2.25
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HDAC6Q9UBN7 1215 aa0.97□□□□□ -2.25
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IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa0.96□□□□□ -2.26
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TBC1D3EA0A087X179 549 aa0.96□□□□□ -2.26
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa0.96□□□□□ -2.26
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TBC1D3BA6NDS4 549 aa0.96□□□□□ -2.26
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP0.96□□□□□ -2.26
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TBC1D3LB9A6J9 549 aa0.96□□□□□ -2.26
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NR5A2O00482 541 aa0.96□□□□□ -2.26
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CAPN9O14815 690 aa0.96□□□□□ -2.26
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HSPA12AO43301 675 aa0.96□□□□□ -2.26
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NCK2O43639 380 aa0.96□□□□□ -2.26
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NDUFS7O75251 213 aa0.96□□□□□ -2.26
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MMP3P08254 477 aa0.96□□□□□ -2.26
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa0.96□□□□□ -2.26
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TBC1D3HP0C7X1 549 aa0.96□□□□□ -2.26
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RNF224P0DH78 156 aa0.96□□□□□ -2.26
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CDH1P12830 882 aa0.96□□□□□ -2.26
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RPL17P18621 184 aaKnown RBP0.96□□□□□ -2.26
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP0.96□□□□□ -2.26
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PIGAP37287 484 aa0.96□□□□□ -2.26
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRIM2P49643 509 aa0.96□□□□□ -2.26
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HSD17B4P51659 736 aa0.96□□□□□ -2.26
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RCAN1P53805 252 aa0.96□□□□□ -2.26
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DRG2P55039 364 aaKnown RBP0.96□□□□□ -2.26
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP0.96□□□□□ -2.26
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP0.96□□□□□ -2.26
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CDK18Q07002 472 aa0.96□□□□□ -2.26
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