RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495350.5

CBX1-205, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CBX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-205ENST00000495350 RHOCP08134 193 aa6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 PAEPP09466 180 aa6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 PRKAR1AP10644 381 aa6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 EPB41P11171 864 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 SRCP12931 536 aa6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 RRM1P23921 792 aa6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 ITGB7P26010 798 aa6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 HTR1BP28222 390 aa6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 CCR1P32246 355 aa6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 ETV5P41161 510 aa6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 ACADSBP45954 432 aa6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 DNA2P51530 1060 aa6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 COPB1P53618 953 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 PFN3P60673 137 aa6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 KLRB1Q12918 225 aa6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 ARHGEF7Q14155 803 aa6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 TCEA2Q15560 299 aa6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 TCERG1LQ5VWI1 586 aa6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 C22orf39Q6P5X5 142 aa6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 TMEM270Q6UE05 265 aa6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 LCLAT1Q6UWP7 414 aa6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 VPS36Q86VN1 386 aa6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 HEATR4Q86WZ0 1026 aa6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 DTX1Q86Y01 620 aa6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 TEX19Q8NA77 164 aa6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 LINC00301Q8NCQ3 95 aa6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 SLC35F5Q8WV83 523 aa6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 MIB2Q96AX9 1013 aa6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 EEF2KMTQ96G04 330 aa6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 B3GNT4Q9C0J1 378 aa6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 TNKS2Q9H2K2 1166 aa6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 POPDC2Q9HBU9 364 aa6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 COX16Q9P0S2 106 aa6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 RABGEF1Q9UJ41 708 aa6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 FADS3Q9Y5Q0 445 aa6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 RNF215Q9Y6U7 377 aa6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 CENPEQ02224 2701 aa6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 ITPR2Q14571 2701 aa6.27□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 LRRK1Q38SD2 2015 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 EFCAB7A8K855 629 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 K7ERQ8 282 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 SNAP91O60641 907 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 ENDOD1O94919 500 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 RASGRP1O95267 797 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 YEATS4O95619 227 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 ADCY5O95622 1261 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 MT-CO1P00395 513 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 KRT7P08729 469 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 LIFP15018 202 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 GLB1P16278 677 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 SYT1P21579 422 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 L1CAMP32004 1257 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 CD97P48960 835 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 HK3P52790 923 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 CDH4P55283 916 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 YPEL5P62699 121 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 CDK17Q00537 523 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 MC1RQ01726 317 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 ADAM9Q13443 819 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 BIRC2Q13490 618 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 NFIL3Q16649 462 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 TPRG1LQ5T0D9 272 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 FBXL22Q6P050 247 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 SHC4Q6S5L8 630 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 BEND5Q7L4P6 421 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 RD3Q7Z3Z2 195 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 PIM3Q86V86 326 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 HID1Q8IV36 788 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 DCAF4L2Q8NA75 395 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 CHST14Q8NCH0 376 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 ATL2Q8NHH9 583 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 CXorf40AQ8TE69 158 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 ASB12Q8WXK4 309 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 RAB7BQ96AH8 199 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 ALG14Q96F25 216 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 PHF12Q96QT6 1004 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 TAAR9Q96RI9 348 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 MED15Q96RN5 788 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 EPAS1Q99814 870 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 HEPHQ9BQS7 1158 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1-205ENST00000495350 EFHD1Q9BUP0 239 aa6.26□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms