RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317118.12

PDE4D-202, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-202ENST00000317118 SLC6A11P48066 632 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 CALCOCO2Q13137 446 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 MPP3Q13368 585 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 ZNF235Q14590 738 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 ARMC3Q5W041 872 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 KCTD11Q693B1 232 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 CEP128Q6ZU80 1094 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 PGBD5Q8N414 524 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 ARRDC2Q8TBH0 407 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 LRRN4Q8WUT4 740 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 CPT1BQ92523 772 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 NUDCD1Q96RS6 583 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 ETNK1Q9HBU6 452 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 RAB6BQ9NRW1 208 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 LHX3Q9UBR4 397 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 RSPH14Q9UHP6 348 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 DUSP12Q9UNI6 340 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 ERVW-1Q9UQF0 538 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 SNX24Q9Y343 169 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 WASH3PC4AMC7 463 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 PPFIA2O75334 1257 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 NEBLO76041 1014 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 KAT7O95251 611 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 AP2A1O95782 977 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 EPOP01588 193 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 APODP05090 189 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 MLNP12872 115 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 NFKB1P19838 968 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 DRD1P21728 446 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 ECHS1P30084 290 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 CTHP32929 405 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 NNMTP40261 264 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 NRLP54845 237 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 GEMP55040 296 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 TFF2Q03403 129 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 ENPP2Q13822 863 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 GRM3Q14832 879 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 PTPRNQ16849 979 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 TMEM196Q5HYL7 178 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 IZUMO3Q5VZ72 239 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 ZDHHC24Q6UX98 284 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 FRS2Q8WU20 508 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 UCMAQ8WVF2 138 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 MYO19Q96H55 970 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 AGAP3Q96P47 875 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 P2RY13Q9BPV8 354 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 GORASP1Q9BQQ3 440 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 PARD6BQ9BYG5 372 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 LRRC40Q9H9A6 602 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 NT5MQ9NPB1 228 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 ANAPC5Q9UJX4 755 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 SLC8A2Q9UPR5 921 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 SORCS3Q9UPU3 1222 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 A0A1W2PQ67 120 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 PRRT4C9JH25 899 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 MAN2B1O00754 1011 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 TRIM24O15164 1050 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 INSIG1O15503 277 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 MT-CO1P00395 513 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 MMP2P08253 660 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 PSMB4P28070 264 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 GALK1P51570 392 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 ITGA8P53708 1063 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 AP1S1P61966 158 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 SARNPP82979 210 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 SKOR1P84550 965 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 SATB1Q01826 763 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 PRKCQQ04759 706 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 BRD3Q15059 726 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 NCEH1Q6PIU2 408 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 PRUNE1Q86TP1 453 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 LINC00523Q86TU6 105 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 RELL1Q8IUW5 271 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 ATP11CQ8NB49 1132 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 USP33Q8TEY7 942 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 LRIG1Q96JA1 1093 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 DPH5Q9H2P9 285 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 ARNT2Q9HBZ2 717 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 PRDM6Q9NQX0 595 aa5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms