RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 TADA2AO75478 443 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 NR2C2P49116 596 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 HERC3Q15034 1050 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 STXBP2Q15833 593 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 FGD3Q5JSP0 725 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 SPANXN3Q5MJ09 141 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 IL31Q6EBC2 164 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 ZYG11AQ6WRX3 759 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM151AQ8N4L1 468 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 REPS2Q8NFH8 660 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 HMGCLL1Q8TB92 370 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 FBXL8Q96CD0 374 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 THAP11Q96EK4 314 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 COX4I2Q96KJ9 171 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 GMLQ99445 158 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 XPR1Q9UBH6 696 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 EGFRP00533 1210 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 GABRB3P28472 473 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 SOX11P35716 441 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 RXRGP48443 463 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 RHDQ02161 417 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 PRKAA1Q13131 559 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 LY6KQ17RY6 165 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM26Q6ZUK4 368 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 KCNMB4Q86W47 210 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 OFCC1Q8IZS5 231 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 OR9I1Q8NGQ6 314 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 SMOXQ9NWM0 555 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 TLK1Q9UKI8 766 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 AURKCQ9UQB9 309 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-206ENST00000469947 HEATR9A2RTY3 570 aa13.71□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 FBP2O00757 339 aa13.71□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 DLX3O60479 287 aa13.71□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 MCF2P10911 925 aa13.71□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 ADORA2BP29275 332 aa13.71□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 ARL4AP40617 200 aa13.71□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 ESRRGP62508 458 aa13.71□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 BNIP3Q12983 259 aa13.71□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 USP10Q14694 798 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 AGKQ53H12 422 aa13.71□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 DCAF6Q58WW2 860 aa13.71□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 NHSL2Q5HYW2 709 aa13.71□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 CBR4Q8N4T8 237 aa13.71□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC16A10Q8TF71 515 aa13.71□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 CANT1Q8WVQ1 401 aa13.71□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 ANKRD60Q9BZ19 345 aa13.71□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 CXCL16Q9H2A7 254 aa13.71□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 ACAD9Q9H845 621 aa13.71□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 LRRC40Q9H9A6 602 aa13.71□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 IL1RL2Q9HB29 575 aa13.71□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 NME7Q9Y5B8 376 aa13.71□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 SCN4AP35499 1836 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 TRIM43BA6NCK2 446 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 ACKR2O00590 384 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 SDHDO14521 159 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 PPEF2O14830 753 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 MPOP05164 745 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 GRIA3P42263 894 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 YAP1P46937 504 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 IER5Q5VY09 327 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 REP15Q6BDI9 236 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF280DQ6N043 979 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 CNTD1Q8N815 330 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC7A14Q8TBB6 771 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 STON2Q8WXE9 905 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 YIPF2Q9BWQ6 316 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 MUC3BQ9H195 1237 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 DPEP3Q9H4B8 488 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 CYP4F12Q9HCS2 524 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 TBC1D23Q9NUY8 699 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 ADAM28Q9UKQ2 775 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC8A2Q9UPR5 921 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 USP3Q9Y6I4 520 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 FUCA1P04066 466 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 NMBRP28336 390 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 PRKCQQ04759 706 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 CD300CQ08708 224 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 PMS2P3Q13401 168 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 ZBED5Q49AG3 693 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.6 ms