RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000086471.11

Suds3-201, Transcript of Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Suds3, Length 2,425 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gm21964A0A1W2P7S4 437 aa23.5■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 6720489N17RikA0A1Y7VJW0 127 aa23.5■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gm7942L7N277 499 aa23.5■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Stat5aP42230 793 aa23.5■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Plpp4Q0VBU9 271 aa23.5■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Maml1Q6T264 1020 aa23.5■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Als2cr12Q8BVM7 383 aa23.5■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cacng3Q9JJV5 315 aa23.5■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Dhx35A2ACQ1 703 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Vmn2r115E9Q0E7 857 aa23.5■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ndst2P52850 883 aa23.5■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gabrr2P56476 465 aa23.5■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Eml1Q05BC3 814 aa23.5■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Krt26Q3TRJ4 462 aa23.5■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Olfml2bQ3V1G4 746 aa23.5■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Nab1Q61122 486 aa23.5■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 SnrpaQ62189 287 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Smad3Q8BUN5 425 aa23.5■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gbp5Q8CFB4 590 aa23.5■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Znf668Q8K2R5 619 aa23.5■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Pih1d1Q9CQJ2 290 aa23.5■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Marc1Q9CW42 340 aa23.5■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 PllpQ9DCU2 182 aa23.5■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Shroom3Q9QXN0 1986 aa23.49■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Plxna4Q80UG2 1893 aa23.49■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Slc23a4A0A0J9YUX7 615 aa23.49■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tnfrsf14A0A1W2P7D5 276 aa23.49■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ttc7bE9Q6P5 843 aa23.49■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Psma3O70435 255 aa23.49■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 AvilO88398 819 aa23.49■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cldn2O88552 230 aa23.49■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 P01670 111 aa23.49■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 P01671 111 aa23.49■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 P01672 111 aa23.49■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ranbp1P34022 203 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ephb3P54754 993 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Smpdl3bP58242 456 aa23.49■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Q3V0E1 1183 aa23.49■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Olfr213Q7TS32 327 aa23.49■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Hdac7Q8C2B3 938 aa23.49■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Vmn1r18Q8R2C8 299 aa23.49■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Pcdha5Q91Y15 934 aa23.49■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Sike1Q9CPR7 207 aa23.49■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tmem135Q9CYV5 458 aa23.49■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Orc3Q9JK30 715 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Malrd1A2AJX4 2123 aa23.49■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Zfp626A0A0U1RQ84 676 aa23.49■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gm1141B9EJU1 475 aa23.49■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ptprn2P80560 1001 aa23.49■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 StacP97306 403 aa23.49■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Serpina6Q06770 397 aa23.49■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Arnt2Q61324 712 aa23.49■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ppp1r26Q6A025 1163 aa23.49■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cplx4Q80WM3 160 aa23.49■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 AarsQ8BGQ7 968 aa23.49■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mterf2Q8BKY8 385 aa23.49■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gtf3c4Q8BMQ2 817 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ubr7Q8BU04 425 aa23.49■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ppp4r1Q8K2V1 951 aa23.49■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Glcci1Q8K3I9 537 aa23.49■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tcf7l2Q924A0 459 aa23.49■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Serbp1Q9CY58 407 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cpxm2Q9D2L5 764 aa23.49■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 IqcdQ9D3V1 458 aa23.49■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 GghQ9Z0L8 317 aa23.49■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tmem240B2RWJ3 173 aa23.48■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ca8P28651 291 aa23.48■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Asgr1P34927 284 aa23.48■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Plk2P53351 682 aa23.48■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Shox2P70390 331 aa23.48■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cdh6P97326 790 aa23.48■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Trim80Q3V061 624 aa23.48■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Otol1Q4ZJM7 482 aa23.48■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Kpna1Q60960 538 aa23.48■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cpsf7Q8BTV2 471 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 AgpsQ8C0I1 645 aa23.48■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ccdc83Q9D4V3 305 aa23.48■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cldn19Q9ET38 224 aa23.48■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Stau1Q9Z108 487 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Rp1P56716 2095 aa23.48■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Nkx1-1G3UXB3 402 aa23.48■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Serpinb6eI7HJI3 429 aa23.48■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Vmn2r70K7N702 854 aa23.48■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 P01810 119 aa23.48■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 PrnpP04925 254 aa23.48■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 MaptP10637 733 aa23.48■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Trappc9Q3U0M1 1148 aa23.48■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 TraddQ3U0V2 310 aa23.48■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Phactr4Q501J7 694 aa23.48■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Slc9b2Q5BKR2 547 aa23.48■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Inpp4bQ6P1Y8 924 aa23.48■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cttnbp2nlQ99LJ0 638 aa23.48■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Oma1Q9D8H7 521 aa23.48■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Chrna6Q9R0W9 494 aa23.48■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Irs2P81122 1321 aa23.48■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gm6370A0A0G2JGX9 315 aa23.47■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Fam43bA2AM80 330 aa23.47■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Dcpp3L7N259 170 aa23.47■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gm6309L7N481 315 aa23.47■■□□□ 1.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Limk2O54785 638 aa23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 21.5 ms