Protein–RNA interactions for Protein: P97306

Stac, SH3 and cysteine-rich domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StacP97306 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37,41■■■■□ 3,58
StacP97306 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,73■■■■□ 3,15
StacP97306 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34,35■■■■□ 3,09
StacP97306 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,03
StacP97306 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,85■■■■□ 3,01
StacP97306 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,61■■■□□ 2,97
StacP97306 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33,2■■■□□ 2,91
StacP97306 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32,57■■■□□ 2,8
StacP97306 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,4■■■□□ 2,78
StacP97306 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32,24■■■□□ 2,75
StacP97306 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32,21■■■□□ 2,75
StacP97306 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,99■■■□□ 2,71
StacP97306 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31,83■■■□□ 2,69
StacP97306 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,8■■■□□ 2,68
StacP97306 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,76■■■□□ 2,67
StacP97306 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,56■■■□□ 2,64
StacP97306 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31,32■■■□□ 2,6
StacP97306 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
StacP97306 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,23■■■□□ 2,59
StacP97306 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31,2■■■□□ 2,59
StacP97306 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,17■■■□□ 2,58
StacP97306 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,17■■■□□ 2,58
StacP97306 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
StacP97306 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,13■■■□□ 2,57
StacP97306 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
StacP97306 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
StacP97306 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31,04■■■□□ 2,56
StacP97306 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
StacP97306 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,92■■■□□ 2,54
StacP97306 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
StacP97306 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30,67■■■□□ 2,5
StacP97306 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
StacP97306 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30,55■■■□□ 2,48
StacP97306 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
StacP97306 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30,46■■■□□ 2,47
StacP97306 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
StacP97306 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
StacP97306 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
StacP97306 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
StacP97306 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30,14■■■□□ 2,42
StacP97306 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
StacP97306 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
StacP97306 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29,77■■■□□ 2,36
StacP97306 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,36
StacP97306 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
StacP97306 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29,75■■■□□ 2,35
StacP97306 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29,73■■■□□ 2,35
StacP97306 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
StacP97306 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
StacP97306 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
StacP97306 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
StacP97306 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
StacP97306 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
StacP97306 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
StacP97306 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,4■■■□□ 2,3
StacP97306 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29,38■■■□□ 2,29
StacP97306 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
StacP97306 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
StacP97306 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29,29■■■□□ 2,28
StacP97306 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
StacP97306 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29,23■■■□□ 2,27
StacP97306 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29,21■■■□□ 2,27
StacP97306 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,2■■■□□ 2,26
StacP97306 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
StacP97306 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
StacP97306 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29,15■■■□□ 2,26
StacP97306 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29,13■■■□□ 2,25
StacP97306 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29,11■■■□□ 2,25
StacP97306 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
StacP97306 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29,05■■■□□ 2,24
StacP97306 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
StacP97306 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29,01■■■□□ 2,23
StacP97306 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
StacP97306 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,86■■■□□ 2,21
StacP97306 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
StacP97306 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
StacP97306 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28,63■■■□□ 2,17
StacP97306 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
StacP97306 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
StacP97306 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28,6■■■□□ 2,17
StacP97306 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28,6■■■□□ 2,17
StacP97306 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
StacP97306 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28,57■■■□□ 2,16
StacP97306 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
StacP97306 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
StacP97306 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
StacP97306 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
StacP97306 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,43■■■□□ 2,14
StacP97306 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
StacP97306 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,4■■■□□ 2,14
StacP97306 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
StacP97306 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
StacP97306 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
StacP97306 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
StacP97306 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
StacP97306 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
StacP97306 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28,33■■■□□ 2,13
StacP97306 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,31■■■□□ 2,12
StacP97306 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28,25■■■□□ 2,11
StacP97306 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,23■■■□□ 2,11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9,9 ms