Protein–RNA interactions for Protein: P97326

Cdh6, Cadherin-6, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh6P97326 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
Cdh6P97326 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Cdh6P97326 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Cdh6P97326 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Cdh6P97326 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Cdh6P97326 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cdh6P97326 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Cdh6P97326 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Cdh6P97326 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Cdh6P97326 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cdh6P97326 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Cdh6P97326 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Cdh6P97326 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
Cdh6P97326 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Cdh6P97326 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Cdh6P97326 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Cdh6P97326 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
Cdh6P97326 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Cdh6P97326 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Cdh6P97326 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Cdh6P97326 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Cdh6P97326 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Cdh6P97326 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Cdh6P97326 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Cdh6P97326 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Cdh6P97326 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Cdh6P97326 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
Cdh6P97326 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Cdh6P97326 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Cdh6P97326 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Cdh6P97326 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Cdh6P97326 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Cdh6P97326 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
Cdh6P97326 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Cdh6P97326 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Cdh6P97326 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Cdh6P97326 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Cdh6P97326 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cdh6P97326 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cdh6P97326 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cdh6P97326 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cdh6P97326 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cdh6P97326 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cdh6P97326 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cdh6P97326 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cdh6P97326 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cdh6P97326 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cdh6P97326 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cdh6P97326 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cdh6P97326 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Cdh6P97326 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Cdh6P97326 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cdh6P97326 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cdh6P97326 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cdh6P97326 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cdh6P97326 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cdh6P97326 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Cdh6P97326 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Cdh6P97326 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cdh6P97326 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Cdh6P97326 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cdh6P97326 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cdh6P97326 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cdh6P97326 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cdh6P97326 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cdh6P97326 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Cdh6P97326 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cdh6P97326 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cdh6P97326 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cdh6P97326 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cdh6P97326 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cdh6P97326 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Cdh6P97326 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cdh6P97326 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cdh6P97326 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cdh6P97326 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cdh6P97326 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cdh6P97326 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cdh6P97326 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cdh6P97326 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cdh6P97326 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cdh6P97326 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdh6P97326 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cdh6P97326 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cdh6P97326 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cdh6P97326 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Cdh6P97326 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cdh6P97326 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cdh6P97326 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cdh6P97326 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cdh6P97326 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cdh6P97326 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cdh6P97326 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cdh6P97326 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cdh6P97326 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cdh6P97326 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cdh6P97326 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cdh6P97326 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cdh6P97326 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cdh6P97326 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms