RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565815.1

LINC00561-201, long intergenic non-protein coding RNA 561, humanhuman

BASIC

Gene LINC00561, Length 2,738 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00561-201ENST00000565815 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 CNTN6Q9UQ52 1028 aa4.56□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa4.56□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 A0A1B0GUL6 1792 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 SMTNL1A8MU46 457 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 H0Y3Z8 333 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 KAT7O95251 611 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 EPHA3P29320 983 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 CYP4F2P78329 520 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 FAM90A2PQ658T7 463 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 ACTRT2Q8TDY3 377 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 HMGB4Q8WW32 186 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 HERVK_113Q902F9 699 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 USP6NLQ92738 828 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 C3orf49Q96BT1 292 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 MMS19Q96T76 1030 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 PDRG1Q9NUG6 133 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 TMOD4Q9NZQ9 345 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 PRDM4Q9UKN5 801 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 AK9Q5TCS8 1911 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 SALL1Q9NSC2 1324 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 LTBP2Q14767 1821 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 CES2O00748 559 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 STX16O14662 325 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 KIAA0355O15063 1070 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 SUV39H1O43463 412 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 HOXC6P09630 235 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 TMEM225BP0DP42 221 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 DRD4P21917 467 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 GKP32189 559 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 GALNSP34059 522 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 SATB1Q01826 763 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 LMAN2Q12907 356 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 SARM1Q6SZW1 724 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 KIRREL2Q6UWL6 708 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 Q6ZWC4 215 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 LCORLQ8N3X6 602 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 ABHD5Q8WTS1 349 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 USP44Q9H0E7 712 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 ECHDC1Q9NTX5 307 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 DLL3Q9NYJ7 618 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 MTMR6Q9Y217 621 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 ZHX2Q9Y6X8 837 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 UTRNP46939 3433 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 LOC285556D6RIA3 1793 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 DOCK1Q14185 1865 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 SNX2O60749 519 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 IGKV5-2P06315 115 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 ATP1A3P13637 1013 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 TNFRSF1AP19438 455 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 THBS4P35443 961 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 SHHQ15465 462 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 KIAA0895LQ68EN5 471 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 TANGO2Q6ICL3 276 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 RUFY3Q7L099 469 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 G2E3Q7L622 706 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 ZNF354CQ86Y25 554 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 HERC6Q8IVU3 1022 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 CAVIN3Q969G5 261 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 ELOVL1Q9BW60 279 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 OGFRQ9NZT2 677 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 MROH7Q68CQ1 1323 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 SLC38A8A6NNN8 435 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 C16orf96A6NNT2 1141 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 NCAM2O15394 837 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 SURF6O75683 361 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 LDHCP07864 332 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 SLC5A2P31639 672 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 CCR5P51681 352 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 KRT24Q2M2I5 525 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
LINC00561-201ENST00000565815 OR4N4Q8N0Y3 316 aa4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 115.9 ms