RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557295.1

LINC00640-204, long intergenic non-protein coding RNA 640, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LINC00640, Length 708 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00640-204ENST00000557295 TULP3O75386 442 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 PIGRP01833 764 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 AMY2AP04746 511 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 CDK4P11802 303 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 AMY2BP19961 511 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 CD6P30203 668 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 GRK6P43250 576 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 MAGEA11P43364 429 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 PPP3CCP48454 512 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 TLE3Q04726 772 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 GAD2Q05329 585 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 GRIN1Q05586 938 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 MYO1EQ12965 1108 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 PDIA5Q14554 519 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 RTP5Q14D33 572 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 C10orf76Q5T2E6 689 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 ARID2Q68CP9 1835 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 RINT1Q6NUQ1 792 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 DHRS13Q6UX07 377 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 MIB1Q86YT6 1006 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 PDCL2Q8N4E4 241 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 TERB1Q8NA31 727 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 ENGASEQ8NFI3 743 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 OTUB2Q96DC9 234 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 SPATA17Q96L03 361 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 MRGPRX1Q96LB2 322 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 ASB7Q9H672 318 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 CFAP97Q9P2B7 532 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 TBC1D14Q9P2M4 693 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 DEC1Q9P2X7 70 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 LRWD1Q9UFC0 647 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 CPQQ9Y646 472 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 EML5Q05BV3 1969 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 E2F8A0AVK6 867 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 MEI4A8MW99 385 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 E9PMD0 336 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 NCAM1P13591 858 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 C6P13671 934 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 CCND1P24385 295 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 LSP1P33241 339 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 HNF1BP35680 557 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 PNPLA4P41247 253 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 IL12RB1P42701 662 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 LIG4P49917 911 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 SESN3P58005 492 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 PRR5P85299 388 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 RHDQ02161 417 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 SEMG2Q02383 582 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 EMC4Q5J8M3 183 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 LY6G5CQ5SRR4 150 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 VSTM1Q6UX27 236 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 CHPFQ8IZ52 775 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 BICD1Q96G01 975 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 TTLL2Q9BWV7 592 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 RNF38Q9H0F5 515 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 CD93Q9NPY3 652 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 DPP3Q9NY33 737 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 EHD2Q9NZN4 543 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 ASH2LQ9UBL3 628 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 GTF3C4Q9UKN8 822 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 L1RE1Q9UN81 338 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 SPO11Q9Y5K1 396 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 ASXL3Q9C0F0 2248 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 PCNX2A6NKB5 2137 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 ABCA7Q8IZY2 2146 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 GABRDO14764 452 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 DTNBO60941 627 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 OAS1P00973 400 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 IGLV3-19P01714 112 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 C1SP09871 688 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 JUPP14923 745 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 OXTRP30559 389 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 WASP42768 502 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 CSRP3P50461 194 aa7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms