RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459697.1

RABGGTB-203, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,177 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-203ENST00000459697 BTBD8Q5XKL5 378 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-203ENST00000459697 CLEC9AQ6UXN8 241 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-203ENST00000459697 ABHD15Q6UXT9 468 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-203ENST00000459697 ASB18Q6ZVZ8 466 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-203ENST00000459697 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-203ENST00000459697 HOMER1Q86YM7 354 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-203ENST00000459697 RHPN2Q8IUC4 686 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-203ENST00000459697 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP5.03□□□□□ -1.63e-8■■■■□ 25.9
RABGGTB-203ENST00000459697 MAPK15Q8TD08 544 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-203ENST00000459697 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-203ENST00000459697 ARRDC3Q96B67 414 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-203ENST00000459697 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-203ENST00000459697 NAPBQ9H115 298 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-203ENST00000459697 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-203ENST00000459697 MMRN2Q9H8L6 949 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-203ENST00000459697 LY9Q9HBG7 655 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-203ENST00000459697 ARHGEF4Q9NR80 690 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-203ENST00000459697 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-203ENST00000459697 ADAM21Q9UKJ8 722 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-203ENST00000459697 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-203ENST00000459697 RAD54BQ9Y620 910 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-203ENST00000459697 SHANK1Q9Y566 2161 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-203ENST00000459697 KNL1Q8NG31 2342 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-203ENST00000459697 MATN2O00339 956 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 YKT6O15498 198 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 PRODHO43272 600 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 GNAI3P08754 354 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 MAKP20794 623 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 CDC25CP30307 473 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 TNFRSF4P43489 277 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 PER3P56645 1201 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 CDC42EP1Q00587 391 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 FOXL1Q12952 345 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 RESTQ13127 1097 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 DUSP8Q13202 625 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 NFYCQ13952 458 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 SFMBT2Q5VUG0 894 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF410Q86VK4 478 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 ZFAND4Q86XD8 727 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 HACE1Q8IYU2 909 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 NLGN4XQ8N0W4 816 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 GRAMD1AQ96CP6 724 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 ZG16BQ96DA0 208 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 CATSPER2Q96P56 530 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 PGLYRP2Q96PD5 576 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 NACAP1Q9BZK3 213 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 LINC00597Q9H2U6 94 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 IPPKQ9H8X2 491 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 KCNH7Q9NS40 1196 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 RIC8BQ9NVN3 520 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 CCDC187A0A096LP49 1063 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 TBC1D3BA6NDS4 549 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 TRIM38O00635 465 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 ZBTB5O15062 677 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 GPAA1O43292 621 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 TRAPPC3O43617 180 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 ZG16O60844 167 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 SDC3O75056 442 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 SOAT2O75908 522 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 B3GAT3O94766 335 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 CCNE2O96020 404 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 PRKAR1AP10644 381 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 GNAT2P19087 354 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 ATP2B1P20020 1258 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 TGM2P21980 687 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 OXTRP30559 389 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 BRCC3P46736 316 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 TPMTP51580 245 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 HHEXQ03014 270 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 NTRK3Q16288 839 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 CTXN3Q4LDR2 81 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 ASPRV1Q53RT3 343 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 FNDC7Q5VTL7 733 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 SDE2Q6IQ49 451 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 USP17L6PQ6QN14 398 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 USP30Q70CQ3 517 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 SGMS1Q86VZ5 419 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 CACUL1Q86Y37 369 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 LDLRAD3Q86YD5 345 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 NOSTRINQ8IVI9 506 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 CHPFQ8IZ52 775 aa5.01□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms