RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486441.1

SDCCAG3-211, Transcript of Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

TSL 5

Gene SDCCAG3, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3-211ENST00000486441 GSDMAQ96QA5 445 aa14.64□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 LGMNQ99538 433 aa14.64□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 TSG101Q99816 390 aa14.64□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 KLF15Q9UIH9 416 aa14.64□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 HS3ST2Q9Y278 367 aa14.64□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 HS3ST4Q9Y661 456 aa14.64□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 PMS2P1A4D2B8 440 aa14.63□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 K7ESM1 405 aa14.63□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 SCAMP1O15126 338 aa14.63□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 P4HA2O15460 535 aa14.63□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 SNAP91O60641 907 aa14.63□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 CSO75390 466 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 NEBLO76041 1014 aa14.63□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 CNTN5O94779 1100 aa14.63□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 BMP6P22004 513 aa14.63□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 GGCXP38435 758 aa14.63□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 ERVPABLB-1P60509 514 aa14.63□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 GABREP78334 506 aa14.63□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 DAB2P98082 770 aa14.63□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 LY6DQ14210 128 aa14.63□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 ACCSLQ4AC99 568 aa14.63□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 TPRG1LQ5T0D9 272 aa14.63□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 ARHGAP40Q5TG30 622 aa14.63□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 SEL1L3Q68CR1 1132 aa14.63□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 TTI2Q6NXR4 508 aa14.63□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 NEK5Q6P3R8 708 aa14.63□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 DSG4Q86SJ6 1040 aa14.63□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 HSCBQ8IWL3 235 aa14.63□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 ZNF683Q8IZ20 524 aa14.63□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 CHST14Q8NCH0 376 aa14.63□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 TMIEQ8NEW7 156 aa14.63□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa14.63□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 VANGL2Q9ULK5 521 aa14.63□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 POM121BA6NF01 834 aa14.62□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 BECN2A8MW95 431 aa14.62□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 RAD51BO15315 384 aa14.62□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 GP1BAP07359 652 aa14.62□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 TGM2P21980 687 aa14.62□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 CHRNA3P32297 505 aa14.62□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 NUCB2P80303 420 aa14.62□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 RHDQ02161 417 aa14.62□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 FZD2Q14332 565 aa14.62□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 ISXQ2M1V0 245 aa14.62□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 ALFQ53S48 1182 aa14.62□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 IGF2-ASQ6U949 168 aa14.62□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 TRIM59Q8IWR1 403 aa14.62□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 LSMEM2Q8N112 164 aa14.62□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 IFT43Q96FT9 208 aa14.62□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 CEP63Q96MT8 703 aa14.62□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 CPXM1Q96SM3 734 aa14.62□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 OSBPL2Q9H1P3 480 aa14.62□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 RMND1Q9NWS8 449 aa14.62□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 NLGN3Q9NZ94 848 aa14.62□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa14.61□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa14.61□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa14.61□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 PAGE1O75459 146 aa14.61□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 CCR1P32246 355 aa14.61□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 OXCT1P55809 520 aa14.61□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 PDCLQ13371 301 aa14.61□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 RABGAP1LQ5R372 815 aa14.61□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 Q6ZSR6 202 aa14.61□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 VCPIP1Q96JH7 1222 aa14.61□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 SLC46A1Q96NT5 459 aa14.61□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 MED15Q96RN5 788 aa14.61□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 DDIT4Q9NX09 232 aa14.61□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 VPS51Q9UID3 782 aa14.61□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 SLC25A13Q9UJS0 675 aa14.61□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 VPS28Q9UK41 221 aa14.61□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 SNX10Q9Y5X0 201 aa14.61□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa14.61□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 WASF2Q9Y6W5 498 aa14.61□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa14.6□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 A0A0D9SEW6 157 aa14.6□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 DRGXA6NNA5 263 aa14.6□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 B8ZZF3 427 aa14.6□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 KLK10O43240 276 aa14.6□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 SPINT1O43278 529 aa14.6□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 EFSO43281 561 aa14.6□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 BNIP3LO60238 219 aa14.6□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 CLDN11O75508 207 aa14.6□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 GRAP2O75791 330 aa14.6□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 ADCY5O95622 1261 aa14.6□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 GLI1P08151 1106 aa14.6□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 KRT10P13645 584 aa14.6□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 RRM1P23921 792 aa14.6□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 TMPRSS3P57727 454 aa14.6□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 CDK17Q00537 523 aa14.6□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms