RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 USP49Q70CQ1 688 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 OVCH2Q7RTZ1 564 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 SFR1Q86XK3 245 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 HSCBQ8IWL3 235 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPR135Q8IZ08 494 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 PDILTQ8N807 584 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZBTB34Q8NCN2 500 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR5M3Q8NGP4 307 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC22A17Q8WUG5 538 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 STON2Q8WXE9 905 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 ING5Q8WYH8 240 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 RAD54LQ92698 747 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM122AQ96E09 287 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 CALML4Q96GE6 196 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 EPSTI1Q96J88 318 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 LRRC37BQ96QE4 947 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 LMF1Q96S06 567 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 TCHPQ9BT92 498 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 COLEC11Q9BWP8 271 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 NT5C3AQ9H0P0 336 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 XYLT2Q9H1B5 865 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 FZD8Q9H461 694 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 MANSC1Q9H8J5 431 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 SEC61A2Q9H9S3 476 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 UBN1Q9NPG3 1134 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 TDP1Q9NUW8 608 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 TBC1D7Q9P0N9 293 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 OAZ3Q9UMX2 235 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 LRRC14BA6NHZ5 514 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPEF2O14830 753 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 LAMTOR5O43504 91 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 STC2O76061 302 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 FPR1P21462 350 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 SYT1P21579 422 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 MUTP22033 750 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 PCSK1P29120 753 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 NMT1P30419 496 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 CNR2P34972 360 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 PTPN7P35236 360 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 STAT6P42226 847 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAP2K6P52564 334 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZXDAP98168 799 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 APBA1Q02410 837 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 ITIH3Q06033 890 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 POU5F1BQ06416 359 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 CUL4AQ13619 759 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 PKP1Q13835 747 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 GIT2Q14161 759 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 GALEQ14376 348 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 GBX1Q14549 363 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 PDIA5Q14554 519 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 SURF1Q15526 300 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 USP41Q3LFD5 358 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPM1LQ5SGD2 360 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 HYIQ5T013 277 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 TTC7BQ86TV6 843 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 DRC7Q8IY82 874 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 MYCT1Q8N699 235 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 IFI44Q8TCB0 444 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 RSPH1Q8WYR4 309 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 STAMQ92783 540 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 CYFIP2Q96F07 1278 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 CLPTM1LQ96KA5 538 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 MRGPRX4Q96LA9 322 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 NECTIN4Q96NY8 510 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 USP28Q96RU2 1077 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 MYADMQ96S97 322 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 KXD1Q9BQD3 176 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 TTPALQ9BTX7 342 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 MFSD1Q9H3U5 465 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 PARVGQ9HBI0 331 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 LANCL2Q9NS86 450 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 FBXW11Q9UKB1 542 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 SORCS3Q9UPU3 1222 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 MTMR6Q9Y217 621 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 TNFSF13BQ9Y275 285 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDY1Q9Y6F8 540 aa4.77□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms