RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 STAU1O95793 577 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 THP07101 528 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 KRT19P08727 400 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 SETSIPP0DME0 302 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 BMP2P12643 396 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 EZRP15311 586 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 KRT15P19012 456 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 BCKDHBP21953 392 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 PROZP22891 400 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 STIP1P31948 543 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 CHKAP35790 457 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 CDKN2BP42772 138 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 IFNAR2P48551 515 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 CLCNKBP51801 687 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 RBP5P82980 135 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 FCHO2Q0JRZ9 810 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 TWF1Q12792 350 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 MYO1EQ12965 1108 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 XRCC4Q13426 336 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 TMED2Q15363 201 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 SNCBQ16143 134 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 HIF1AQ16665 826 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 QPCTQ16769 361 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 GLRA4Q5JXX5 417 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 HHATQ5VTY9 493 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 FYB2Q5VWT5 728 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 NUGGCQ68CJ6 796 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 FSTL4Q6MZW2 842 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC27A1Q6PCB7 646 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 C1orf228Q6PIY5 440 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 BBS12Q6ZW61 710 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 CYP2U1Q7Z449 544 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 SPATA21Q7Z572 469 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC91Q7Z6B0 441 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 CPNE8Q86YQ8 564 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 RFX6Q8HWS3 928 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 PDIK1LQ8N165 341 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 ANKRD42Q8N9B4 389 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC63Q8NA47 563 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 KCTD6Q8NC69 237 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 C3orf58Q8NDZ4 430 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF461Q8TAF7 563 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 MAGEC3Q8TD91 643 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 MGARPQ8TDB4 240 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 FBF1Q8TES7 1133 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 TUBB6Q9BUF5 446 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC32A1Q9H598 525 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 VRTNQ9H8Y1 702 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 VPS37BQ9H9H4 285 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 TRPV4Q9HBA0 871 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 FSCN3Q9NQT6 498 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 ASAH2Q9NR71 780 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 TXLNGQ9NUQ3 528 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 DNMT3LQ9UJW3 386 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 ITGA11Q9UKX5 1188 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 DNPEPQ9ULA0 475 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 BACE2Q9Y5Z0 518 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 IKBKGQ9Y6K9 419 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 PCDH15Q96QU1 1955 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 PTPRJQ12913 1337 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 GOLGA8SH3BPF8 625 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM189A1O60320 539 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 RASSF9O75901 435 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 DCTN3O75935 186 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 C1QL1O75973 258 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 MICAL2O94851 1124 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 ABLIM3O94929 683 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 ZWINTO95229 277 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 CST3P01034 146 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 EGFP01133 1207 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 CALCAP01258 141 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 IFNB1P01574 187 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 APOC2P02655 101 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 KDELR1P24390 212 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 PCK1P35558 622 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 GABRB2P47870 512 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 RASSF2P50749 326 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC15Q0P6D6 951 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 C19orf57Q0VDD7 668 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM132DQ14C87 1099 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 PDK2Q15119 407 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 OASLQ15646 514 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC38Q502W7 563 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
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