RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530513.5

PACSIN3-207, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-207ENST00000530513 HES3Q5TGS1 186 aa22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-207ENST00000530513 C14orf80Q86SX3 495 aa22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-207ENST00000530513 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-207ENST00000530513 TRIM69Q86WT6 500 aa22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-207ENST00000530513 OXR1Q8N573 874 aa22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-207ENST00000530513 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-207ENST00000530513 DCBLD2Q96PD2 775 aa22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-207ENST00000530513 PCDHGC3Q9UN70 934 aa22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-207ENST00000530513 CA5BQ9Y2D0 317 aa22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-207ENST00000530513 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-207ENST00000530513 ALOX15BO15296 676 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-207ENST00000530513 BNIP3LO60238 219 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-207ENST00000530513 SDC3O75056 442 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-207ENST00000530513 PAGE1O75459 146 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-207ENST00000530513 JUPP14923 745 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-207ENST00000530513 TAS2R38P59533 333 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-207ENST00000530513 PTPN20Q4JDL3 420 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-207ENST00000530513 FAM46CQ5VWP2 391 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-207ENST00000530513 OR6B2Q6IFH4 312 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-207ENST00000530513 FBXL19Q6PCT2 694 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-207ENST00000530513 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-207ENST00000530513 SH2D3CQ8N5H7 860 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-207ENST00000530513 FAM81BQ96LP2 452 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-207ENST00000530513 ANLNQ9NQW6 1124 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-207ENST00000530513 DMTF1Q9Y222 760 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-207ENST00000530513 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-207ENST00000530513 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 MCF2LO15068 1137 aa22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 C1SP09871 688 aa22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 C6orf118Q5T5N4 469 aa22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 GBP6Q6ZN66 633 aa22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 IQCHQ86VS3 1027 aa22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 CREBRFQ8IUR6 639 aa22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 PSMB7Q99436 277 aa22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 I6L893 689 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 M0QYT0 321 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 CLDN11O75508 207 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 CNTN5O94779 1100 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 CTSLP07711 333 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 SRCP12931 536 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 NUDT1P36639 197 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 EXOC3L4Q17RC7 722 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 SLC26A9Q7LBE3 791 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 NOX5Q96PH1 765 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 MYOCQ99972 504 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 SIK2Q9H0K1 926 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 MUC3BQ9H195 1237 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 SIX2Q9NPC8 291 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 PLCB1Q9NQ66 1216 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 PIGVQ9NUD9 493 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 RWDD2AQ9UIY3 292 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 HS3ST2Q9Y278 367 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 SNX10Q9Y5X0 201 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 SHROOM3Q8TF72 1996 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 SNAP91O60641 907 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 MT-CO1P00395 513 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 CDK4P11802 303 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 ZNF18P17022 549 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 PON1P27169 355 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 ABCG1P45844 678 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 STAT4Q14765 748 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 CAMK4Q16566 473 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 C5orf22Q49AR2 442 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 ALFQ53S48 1182 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 SLC47A2Q86VL8 602 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 IRF2BP1Q8IU81 584 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 PPP1R9BQ96SB3 815 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 PREBQ9HCU5 417 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 K7ERQ8 282 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 RNF103O00237 685 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 ADCY5O95622 1261 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 PRLRP16471 622 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 CKMT2P17540 419 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 NOS2P35228 1153 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 CDH4P55283 916 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 SLC6A3Q01959 620 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 SEMG2Q02383 582 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 OVGP1Q12889 678 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 PROX2Q3B8N5 592 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 ZNF683Q8IZ20 524 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 TMEM145Q8NBT3 493 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 KLK6Q92876 244 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 SYNCQ9H7C4 482 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 CAAP1Q9H8G2 361 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 VPS51Q9UID3 782 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 KALRNO60229 2985 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
PACSIN3-207ENST00000530513 TRIM38O00635 465 aa22.91■■□□□ 1.26
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