RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452765.6

SH3BP2-204, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-204ENST00000452765 C9orf72Q96LT7 481 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 EPB41L4BQ9H329 900 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 BPTFQ12830 3046 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 DOCK8Q8NF50 2099 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 GFRA2O00451 464 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 GJB3O75712 270 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 NFKB1P19838 968 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 TSGA13Q96PP4 275 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP21.36■■□□□ 1.014e-7■■■□□ 18.8
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 PPFIA2O75334 1257 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 FGF19O95750 216 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 MAXP61244 160 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 GNA12Q03113 381 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 SERINC3Q13530 473 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 ADGRE1Q14246 886 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 TMEM25Q86YD3 366 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 SPATA22Q8NHS9 363 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 EXOC4Q96A65 974 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 WNT6Q9Y6F9 365 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 A0A1B0GVM2 712 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 TCAF2A6NFQ2 919 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 H0Y626 953 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF197O14709 1029 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 MATN3O15232 486 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 USP12O75317 370 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 MAPKAPK2P49137 400 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 IL31Q6EBC2 164 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 CAPN12Q6ZSI9 719 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 ANKMY2Q8IV38 441 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP21.35■■□□□ 1.015e-14■■■□□ 16
SH3BP2-204ENST00000452765 BBOF1Q8ND07 529 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 FGF13Q92913 245 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 SAYSD1Q9NPB0 183 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 CLEC1BQ9P126 229 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 CLUHO75153 1309 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 ARHGAP42A6NI28 874 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 CLDN11O75508 207 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 HLA-DQB2P05538 268 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 PMS2P54278 862 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 KYNUQ16719 465 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 NPAS3Q8IXF0 933 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 LEMD2Q8NC56 503 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP21.34■■□□□ 1.019e-7■■■■■ 77.3
SH3BP2-204ENST00000452765 TEKT5Q96M29 485 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 SP110Q9HB58 689 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 OPHN1O60890 802 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 STK10O94804 968 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 ACSL3O95573 720 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 RHOCP08134 193 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 MTA1Q13330 715 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 ANKRD54Q6NXT1 300 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 FAM217AQ8IXS0 508 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 MICALL1Q8N3F8 863 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 EFHBQ8N7U6 833 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 BRD8Q9H0E9 1235 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 RSPH14Q9UHP6 348 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 SHOC2Q9UQ13 582 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 TRIOO75962 3097 aa21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 E7EVH7 732 aa21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 SNAP91O60641 907 aa21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 TBX10O75333 385 aa21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 CAV1Q03135 178 aa21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF77Q15935 545 aa21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 FAM78AQ5JUQ0 283 aa21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 TRIM68Q6AZZ1 485 aa21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 LINGO4Q6UY18 593 aa21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 GPR149Q86SP6 731 aa21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 ZFYVE19Q96K21 471 aa21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 ZIM3Q96PE6 472 aa21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 APOL2Q9BQE5 337 aa21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
SH3BP2-204ENST00000452765 FSHRP23945 695 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP2-204ENST00000452765 RGS19P49795 217 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF534Q76KX8 674 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP2-204ENST00000452765 KDELC2Q7Z4H8 507 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP2-204ENST00000452765 PCGF5Q86SE9 256 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP2-204ENST00000452765 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms