RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368045.3

CD48-201, Transcript of CD48 molecule, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CD48, Length 1,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD48-201ENST00000368045 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa14.57□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 VTI1BQ9UEU0 232 aa14.57□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa14.57□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 RAP2CQ9Y3L5 183 aa14.57□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 YJEFN3A6XGL0 299 aa14.56□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 PTGESO14684 152 aa14.56□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 CABYRO75952 493 aa14.56□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 SRGAP2BP0DMP2 458 aa14.56□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 THRAP10827 490 aa14.56□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 NFKB1P19838 968 aa14.56□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 CXCR3P49682 368 aa14.56□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 CUL3Q13618 768 aa14.56□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 UGP2Q16851 508 aa14.56□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 RALGPS1Q5JS13 557 aa14.56□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 CERCAMQ5T4B2 595 aa14.56□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 TNS4Q8IZW8 715 aa14.56□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 SLC25A41Q8N5S1 370 aa14.56□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 NPWQ8N729 165 aa14.56□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 ZNF781Q8N8C0 355 aa14.56□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 ARRDC4Q8NCT1 418 aa14.56□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 MS4A4AQ96JQ5 239 aa14.56□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 SENP8Q96LD8 212 aa14.56□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa14.56□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 AGAP2Q99490 1192 aa14.56□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 SMOQ99835 787 aa14.56□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 COLEC11Q9BWP8 271 aa14.56□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 DRC3Q9H069 523 aa14.56□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 RHOJQ9H4E5 214 aa14.56□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 SLC24A3Q9HC58 644 aa14.56□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 CRTAC1Q9NQ79 661 aa14.56□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 TLK1Q9UKI8 766 aa14.56□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 KAT6AQ92794 2004 aa14.56□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 SCN4AP35499 1836 aa14.56□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 TSC2P49815 1807 aa14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 CCDC189A1A4V9 331 aa14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 MATN2O00339 956 aa14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 HDAC3O15379 428 aa14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 DCXO43602 365 aa14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 PEX1O43933 1283 aa14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 CACNG3O60359 315 aa14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 SMIM24O75264 130 aa14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 USP12O75317 370 aa14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 LYNP07948 512 aa14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 NCAM1P13591 858 aa14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 CALRP27797 417 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 CYP2C18P33260 490 aa14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 EPHX2P34913 555 aa14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 MTTPP55157 894 aa14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 ASPHQ12797 758 aa14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 ZBTB17Q13105 803 aa14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 LIPMQ5VYY2 423 aa14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 PM20D1Q6GTS8 502 aa14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 NAPRTQ6XQN6 538 aa14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 PDSS2Q86YH6 399 aa14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 DEFB107AQ8IZN7 70 aa14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 SCML4Q8N228 414 aa14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 PHTF2Q8N3S3 785 aa14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 DPF3Q92784 378 aa14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 MFSD3Q96ES6 412 aa14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 TRIM62Q9BVG3 475 aa14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 TCF7L2Q9NQB0 619 aa14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 CDH9Q9ULB4 789 aa14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 POMPQ9Y244 141 aa14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 SBF1O95248 1867 aa14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 KIF3CO14782 793 aa14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 ZBTB14O43829 449 aa14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 ATP9BO43861 1147 aa14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 HTR7P34969 479 aa14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 EPHB1P54762 984 aa14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 IRF9Q00978 393 aa14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 USP4Q13107 963 aa14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 PRKAA1Q13131 559 aa14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 OLIG2Q13516 323 aa14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 HERC3Q15034 1050 aa14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 CCL15Q16663 113 aa14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 KIAA0319Q5VV43 1072 aa14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 ARMC3Q5W041 872 aa14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 C16orf89Q6UX73 402 aa14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 FRMD7Q6ZUT3 714 aa14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 ACAD11Q709F0 780 aa14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 ARHGAP18Q8N392 663 aa14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 SLC26A7Q8TE54 656 aa14.55□□□□□ -0.08
CD48-201ENST00000368045 AZIN2Q96A70 460 aa14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms